四川地区一株锦鲤疱疹病毒的分离鉴定及系统进化分析
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关键词:
- 鲤 /
- 锦鲤疱疹病毒 /
- 鲤疱疹病毒III型(CyHV-3) /
- 病毒分离鉴定 /
- 系统进化分析
Isolation and identification of a koi herpesvirus and phylogenetic analysis from Sichuan Province
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锦鲤疱疹病毒病(koi herpesvirus disease, KHVD)是由锦鲤疱疹病毒(koi herpesvirus, KHV)感染引起鲤(Cyprinus carpio)、锦鲤以及鲤变种鳃坏死和间质性肾炎的一种高传染性、高死亡率的疾病,致死率高达80%~100%[1-3]。世界动物卫生组织(OIE)和中国都将KHVD列为必须申报的疾病,中国农业部将其列为Ⅱ类动物疫病[4-5]。该病主要发生在春秋季,水温为18~28 °C易暴发[6-7]。成鱼和幼鱼对KHV都敏感,小鱼(1~3月龄,2.5~6 g)的敏感性高于大鱼(1龄,约230 g)[8]。1998年,在以色列、美国和德国最早报道KHV引起大面积鲤和锦鲤死亡,随后在欧洲、亚洲、非洲和澳大利亚都有锦鲤疱疹病毒病暴发[1,9],呈世界性流行与分布。2001年,中国香港最早暴发了KHVD,后来在广州、武汉、深圳、长春等东部沿海城市和地区有该病暴发的报道[10],2011年,KHV在辽宁省(KHV-cj)和广东省(KHV-GZ11)首次成功分离[11-12]。然而,在我国西南地区还未见KHVD流行的报道,本研究首次报道KHV在我国西南地区暴发,并且实验成功分离得到病毒。
2015年5月,四川某养殖场鲤发生大面积死亡,发病鱼体表黏液增多,全身多处明显出血,眼球凹陷,鳃丝腐烂、出血、严重坏死。剖检后可见肝脏、肾脏肿大,然而从内脏器官未分离到细菌,并且通过实验证明不是寄生虫感染。根据临床特征和病理学观察,初步诊断为KHV感染,针对OIE推荐的KHVSph基因设计检测引物进行PCR检测,出现特异性扩增产物。为进一步验证是KHV导致鲤的大面积死亡,采集患病鱼组织病料接种CCB细胞,成功分离出一株KHV并且稳定传代。根据TK基因全长序列建立系统进化树,证实该病毒属于亚洲1型毒株,暂命名为KHV-SC株。本研究首次报道KHV在我国西南地区暴发流行。
1. 材料与方法
1.1 病料、细胞和实验对象
病鱼采集于2015年5月,来源于四川成都某鲤养殖场,体长25~35 cm。健康鲤(体长25~30 cm)40条,购自四川成都某鲤养殖场。普通鲤脑细胞系(CCB)由深圳出入境检验检疫局刘荭研究员馈赠。CCB细胞在含10% FBS的MEM培养基,25 °C 5% CO2恒温培养箱中培养。
1.2 主要试剂
MEM培养基、胎牛血清购自Sigma公司;病毒DNA提取试剂盒、小剂量质粒抽提试剂盒、pMD19-T质粒连接试剂盒、组织DNA提取试剂盒和胶回收试剂盒购自TaKaRa公司。
1.3 细菌学检查
对病鱼进行解剖观察,同时取肝脏、脾脏、肾脏和脑等组织器官于洁净载玻片上涂片,风干后革兰氏染色,显微镜观察。无菌条件下,从病鱼肝脏、脾脏和肾脏取样于BHI平板上划线接种,28 °C恒温培养24~48 h后观察细菌生长状况。
1.4 组织病理学
取病鱼的鳃、肾脏、肝脏、脾脏、脑和肠道等组织器官,10%的中性福尔马林固定,常规石蜡切片,H.E染色,中性树胶封片后光学显微镜下观察其主要病变并拍照记录。
1.5 人工感染动物实验
取濒死鲤的肝脏、肾脏组织,用无菌生理盐水以1∶5(重量体积比) 在冰上匀浆。4 °C下以3000、6000和9000 r/min依次梯度离心10 min; 取上清液于0.22 μm的滤膜过滤灭菌。将健康鲤分为2组,每组20尾。实验组每尾注射0.2 mL的组织匀浆液,对照组每尾注射0.2 mL无菌生理盐水,采用腹腔注射方式。实验期间水温控制在20~25 °C,每天观察2次,连续观察4周。
1.6 病毒分离培养和电镜观察
收集病鱼的肾脏、肝脏、脾脏等组织共3 g,加入10倍体积(V/W)含有双抗的细胞培养液(100 μg/mL青霉素、100 μg/mL链霉素),使用全自动样品快速研磨仪(上海净信科技)研磨成组织匀浆液,4 °C过夜处理。4 °C,7000 r/min离心15 min,取出上清液,按照以上条件再离心2次。将上清液用MEM培养基进行10倍、100倍梯度稀释,取1 mL加入到单层细胞的培养瓶中,置于25 °C培养箱中,逐日观察细胞病变(CPE),收集CPE达70%~80%的细胞及上清液,–80 °C保存备用。待接种病毒细胞CPE达到70%~80%时,刮取细胞,4000 r/min离心5 min,PBS洗涤细胞沉淀,加入2.5%戊二醛固定,按常规方法进行1%锇酸固定、乙醇脱水、环氧树脂包埋,超薄切片透射电镜观察。
1.7 PCR鉴定
发病鱼、人工感染鱼、健康鱼的组织DNA与感染CCB细胞的DNA提取按照提取试剂盒的说明进行操作。根据OIE推荐的鉴定锦鲤疱疹病毒的Sph基因进行检测。
引物设计与合成 根据GenBank公布的KHV美国株(KHV-U,ID:DQ657948.1)基因序列,选取保守的Sph基因(ORF54),应用Primer 5与Oligo软件设计引物,F: 5′-GCCCAAGAGCTGCTGGTA-3′;R:5′-ACCTGCCTGCAGACAATCAT-3′,PCR扩增产物预期为690 bp。引物由成都擎科生物技术有限公司合成。
病毒DNA的提取与PCR鉴定 收集CPE病变达70%~80%的细胞培养物,按照病毒DNA提取试剂盒使用说明书提取DNA,并进行PCR扩增。PCR扩增体系(25 μL):12.5 μL 2×PCR Master Mix,上游引物、下游引物各1 μL,模板2 μL,加ddH2O至25 μL;扩增条件:94 °C预变性5 min;94 °C变性30 s,54 °C复性45 s,72 °C延伸45 s,35个循环;72 °C延伸5 min,用1%琼脂糖凝胶电泳分析PCR产物,得到约0.7 kb的PCR产物。
1.8 TK基因全序列克隆测序及系统发育分析
TK基因是一段长约997~1007 bp,编码胸苷激酶的基因序列,国内外许多学者采用TK基因对KHV毒株进行系统发育分析[11,13]。按照文献[11]介绍的方法合成一对扩增TK基因全序列的引物,上游引物:5′-AACGCGGGCCAGCTGAACAT-3′,下游引物:5′-TGTGTGTATCCCAATAAACG-3′,预期扩增片段大小为997~1007 bp。反应体系同步骤“病毒DNA的提取与PCR鉴定”;PCR扩增条件:94 °C预变性5 min;94 °C变性30 s,55 °C退火30 s,72 °C延伸60 s,共35个循环;72 °C延伸10 min。PCR产物经DNA纯化试剂盒纯化后,按操作说明书连接到pMD19-T载体上,转化DH5α感受态细胞中。培养24 h后,挑取单个菌落进行菌落PCR筛选阳性克隆菌株,提取质粒送成都擎科生物技术有限公司进行序列测定。将测序结果通过NCBI的Blast查找同源性序列,以FASTA格式下载并整合。采用MEGA 6.0的clustalw (codons)功能将整理序列排序,以置信度百分比(bootstrap replications)为1000,使用邻接法构建系统发育树。
2. 结果
2.1 解剖和细菌学检查
发病鱼体表黏液增多,全身多处明显出血,眼球凹陷,鳃丝腐烂、出血、严重坏死(图1)。剖检后可见肝脏、肾脏肿大。涂片检查未观察到细菌,也未从发病鱼的肝脏、脾脏和肾脏中分离到细菌。
2.2 组织病理学观察
采集患病鱼的外部器官(鳃)和内部器官(肾脏)制作病理切片观察。与对照组比较(图2-a),病鱼鳃丝血管扩张充血,鳃小片呼吸上皮细胞肿胀、脱落。鳃丝基部的上皮细胞大量增生,层次增多,填充了1/3至1/2的鳃小片,并且向远端延伸(图2-b)。在内部器官的观察中,与对照组(图2-c)比较,肾小管上皮细胞组织结构紊乱,细胞肿胀,呈颗粒变性,管腔变狭小,有崩裂和坏死现象;病变周围间隙组织血管扩张充血,有大量炎性细胞渗出(图2-d),与以往的研究结果一致[1,14]。
2.3 人工感染实验
实验组鲤注射感染第3天开始出现临床症状,鱼变得冷漠不爱动,体表黏液分泌增多,食欲减退。第6天开始出现死亡,第14天累积死亡率达90%,连续观察3周。动物感染主要表现为急性死亡,出现与自然发病鱼相同的临床表现。对照组全部存活无异常(图3)。
2.4 病毒分离
病鱼组织匀浆滤菌并感染CCB细胞,盲传3代可以稳定地观察到典型的CPE,细胞单层呈破渔网状(图4-b),而对照组CCB细胞生长致密且无空泡出现(图4-a)。将病毒分离株暂命名为KHV-SC。
2.5 电镜观察
在透射电镜下可观察到细胞胞质内有大量成熟和不成熟的病毒粒子,将单个病毒粒子放大,其形态如小图所示(图5)。病毒为二十面体对称,有囊膜,直径为180~200 nm,呈现典型的疱疹病毒结构。
2.6 PCR鉴定
对2条自然发病和2条人工感染发病鱼的组织DNA和病毒细胞培养物的DNA进行PCR检测,凝胶电泳检测结果显示,扩增条带约700 bp,与预期相符(图6)。
图 6 PCR检测结果M. DL2000 DNA marker;1~2. 自然发病鱼;3~4. 人工感染鱼;5. KHV感染细胞DNA;6. 健康鱼Figure 6. Detection results of PCRM. DL2000 DNA marker; 1–2. DNA isolated from naturally infected fish tissue; 3–4. DNA isolated from experimentally infected fish tissue; 5. DNA isolated from infected cell; 6. DNA isolated from healthy fish tissue2.7 序列分析与进化树构建
将TK全长序列克隆到pMD19-T载体中,送成都擎科生物技术有限公司进行序列测定。结果显示,分离株TK基因全长997 bp。测序结果与GenBank中登录的KHV序列进行比较,依据邻接法利用MEGA 6.0建立进化树(图7),证实本实验所分离的毒株为亚洲1型毒株(图7),与日本株(J:AP008984)、印度尼西亚KO5(HM347098)和CO7(HM347099)株同源性均为100%。以色列毒株(I strain)与亚洲1型毒株同源关系较近,这与以往的研究报道一致[15-16]。
3. 讨论
KHV感染的典型临床症状表现为行动迟缓、食欲不振、体表黏液增多、胸鳍及腹鳍出现出血斑、眼球凹陷,病鱼鳃局部或全部苍白并伴随不同程度的鳃坏死。解剖后可见脾脏、肾脏暗红并充血肿大,未从内脏中分离到细菌。典型的病理损伤表现为间质性肾炎、鳃小片上皮细胞肿胀、脱落,肾小管上皮细胞组织结构紊乱、细胞肿胀、管腔变狭小,有崩裂和坏死现象。Miwa等[17]还发现病毒可在肾脏和鳃上皮细胞内形成包涵体。本次病例的临床症状和组织病理损伤与以前的报道基本一致[18-19]。通过人工感染实验、PCR检测、病毒分离以及TK全基因系统发育分析,证实此次造成四川地区养殖鲤大面积死亡的病原为KHV。
目前,我国KHVD的流行和暴发主要集中在南部沿海和东北地区,如广东、黑龙江和吉林等,国内报道并成功分离的KHV病毒株有辽宁株(KHV-cj)、广东分离的广州株(KHV-GZ11和KHV-GZ1301)和黑龙江分离的KHV-hlj株等[20]。本研究首次报道KHVD在我国西南地区暴发,并且成功分离得到了KHV-SC株。四川省是淡水鱼养殖大省,全省水产养殖面积19.61万hm2,水产品总产量达到137 万t,主要养殖鲤、草鱼(Ctenopharyngodon idella)、鲫(Carassius auratus)、鳙(Aristichthys nobilis)、鲢(Hypophthalmictuthys molitrix)[21]。锦鲤疱疹病毒病(KHVD)具有高传染性、高死亡率,死亡率达80%~100%,已在世界范围内流行,具有潜伏感染的特性[22],严重威胁全世界鲤和锦鲤养殖业的安全[23]。
OIE推荐KHV的检测基因为TK和Sph。Sph属于保守性很强的聚合酶基因,有很好的特异性,能够将与CyHV-3亲缘关系很近的鲤痘疱疹病毒(CyHV-1)、金鱼造血器官坏死病病毒(CyHV-2)和鳗鱼疱疹病毒(AngHV)区别开[24-25]。TK基因是一条长为997~1007 bp,编码胸苷激酶的基因,保守性强,突变点稳定,通过该基因可以对世界范围内的KHV毒株进行分型,国内外很多学者都采用了TK基因对KHV毒株进行系统发育树分析[11,13,26]。Kurita等[13]通过基因组学对世界范围内大量的KHV毒株进行分析,证明来自亚洲和欧洲的隔离群有着明显的基因差异,可通过对TK 基因全长序列的测定将KHV毒株区分为欧洲型和亚洲型,亚洲型分为亚洲1型和亚洲2型,欧洲型分为E1~E7共7个毒株型[26]。本研究获得TK基因全长序列为997 bp,经MEGA 6.0构建进化树,表明KHV-SC属于亚洲1型毒株。本课题组首次从西南地区分离得到一株KHV,并且对其致病性进行了研究,为KHV起源进化、分类以及疾病诊断和防控提供理论依据。
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图 6 PCR检测结果
M. DL2000 DNA marker;1~2. 自然发病鱼;3~4. 人工感染鱼;5. KHV感染细胞DNA;6. 健康鱼
Figure 6. Detection results of PCR
M. DL2000 DNA marker; 1–2. DNA isolated from naturally infected fish tissue; 3–4. DNA isolated from experimentally infected fish tissue; 5. DNA isolated from infected cell; 6. DNA isolated from healthy fish tissue
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