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基于环境DNA的岩原鲤检测及生物量评估
闫卉果, 董智玲, 马婷婷, 张连博, 王晓艳, 叶华, 姚维志, 何文平
 doi: 10.11964/jfc.20211013098
[摘要](9) [HTML 全文](2) [PDF 1131KB](0)
摘要:
为建立岩原鲤基于环境DNA (eDNA)的实时荧光定量PCR (qPCR)检测方法,准确鉴别岩原鲤并探讨eDNA浓度与其生物量的定量关系,实验根据岩原鲤mtDNA中12S rRNA基因序列设计eDNA引物和TaqMan探针,利用 PCR 扩增出岩原鲤12 rRNA基因的序列,克隆入 pMD19-T载体,构建重组质粒作为 qPCR 标准;使用梯度稀释质粒标准品作为模板,进行 qPCR 扩增,制作标准曲线,建立岩原鲤 qPCR 检测方法,并评价其特异性、灵敏性和应用效果。结果显示,引物和 TaqMan探针对供试的岩原鲤样品出现荧光增长曲线,显示阳性扩增,而其他鱼类和空白对照均未得到扩增信号,表现为阴性;qPCR 的阈值循环数 (Ct)与标准品拷贝数的线性关系好,且线性范围广,获得的标准曲线相关系数 (R2) 达到 0.999,检测限位DNA浓度为5×10−6 ng/μL,扩增效率为94.7%;检测养殖不同数量岩原鲤的水体中 eDNA浓度,目标 DNA 浓度和岩原鲤数量存在线性正相关性 (R2=0.957),得到岩原鲤DNA 浓度与其个体数量的相关性曲线:y = 131 546x + 77 623;去除岩原鲤后, eDNA的拷贝数与时间负相关,其在水体环境中的存留时间为17 d。研究表明,该岩原鲤 eDNA引物和TaqMan探针既能应用于水体中岩原鲤的定性检测,特异性高、时效性好;又能定量检测出环境中岩原鲤的密度,有利于反映出岩原鲤在不同样点的生物量及时空动态,从而为评价岩原鲤人工放流效果和管理保护资源提供参考。
大陈洋产卵场保护区鱼类群落结构特征及其与环境因子的关系
芮银, 蒋日进, 王好学, 栾会妮, 印瑞, 朱玉丹, 张琳琳
 doi: 10.11964/jfc.20200912421
[摘要](28) [HTML 全文](2) [PDF 2062KB](0)
摘要:
为了解大陈洋产卵场保护区的保护效果,基于2018年4月(春季)和11月(秋季)在大陈洋产卵场保护区的渔业资源调查数据,利用相对重要性指数(IRI)、多样性分析、聚类分析和典范对应分析(CCA)等方法,对该海域鱼类群落结构特征及其与环境因子的关系进行了相关分析。结果显示,共捕获鱼类83种,隶属于9目51科,其中优势种鱼类2种,重要种18种,隶属于5目11科,优势种为六丝钝尾虾虎鱼和龙头鱼。等级聚类(CLUSTER)和非度量多维测度(NMDS)分析表明,春、秋季鱼类群落在空间上均可分为3组且群落组间差异显著,龙头鱼、七星底灯鱼、赤鼻棱鳀等是影响群落结构季节变化的主要分歧种。ABC曲线分析表明,春季鱼类群落受到中度干扰(W=0.027);秋季鱼类群落处于较为严重干扰状态(W=−0.185)。典范对应(CCA)分析表明,水深、温度和盐度为影响该海域鱼类种类组成及群落结构时空变化的重要海洋理化因子。与2015年和2017年同期资源量相比,2018年11月生物量和丰度均大幅度增加。研究表明,保护区的建立对渔业资源恢复起到了一定的保护作用,但想要将海洋资源恢复到理想状态,需要进行长久的资源保护。
文蛤动态能量收支模型构建、验证与应用
张虎, 张俊波, 杨晨星, 贲成恺, 袁健美, 胡海生, 肖悦悦, 吕泽华, 万荣
 doi: 10.11964/jfc.20210712954
[摘要](60) [HTML 全文](7) [PDF 2025KB](0)
摘要:
文蛤是我国重要的经济贝类之一,利用数学模型准确模拟预测其在自然水域中的生长过程,对文蛤生态容量评估等定量研究具有重要的理论意义和应用价值。实验根据动态能量收支理论,基于R语言构建了文蛤动态能量收支模型,采用线性与非线性回归法估算模型参数,通过对比围塘环境下文蛤壳长、湿重、软体部湿重的实测值与模拟值验证模型,并应用于模拟黄海海域滩涂区文蛤的生长过程。结果显示,文蛤模型主要参数形状系数、阿伦纽斯温度系数和单位体积结构物质所需能量分别为0.57、9278 K和2056 J/cm3;实测与模拟的文蛤壳长、湿重和软体部湿重相关系数R2平均为0.996,模拟值与实测值的平均误差为3.58%;如东沿海区域6月实测文蛤软体部干重为0.48 g,壳长3.12 cm,模型模拟的软体部干重、湿重和壳长分别为0.476 g,6.6 g和3.2 cm。研究表明,本研究构建的文蛤动态能量收支模型的准确度较高,可真实地反映出文蛤在自然水域中的生长过程,为评估文蛤生态容纳量及构建文蛤相关的生态系统模型提供科学参考。
山东近海渔业物种多样性与环境因子关系
徐茂真, 张崇良, 薛莹, 徐宾铎, 纪毓鹏, 任一平
 doi: 10.11964/jfc.20201012468
[摘要](34) [HTML 全文](4) [PDF 1662KB](0)
摘要:
当前山东近海的渔业资源与生态环境面临较大压力,对海洋中的生物多样性水平有着较大影响。为探究山东近海生物多样性的空间分布特征及影响多样性水平的环境因子,实验基于2017年冬季在山东近海进行的渔业资源和环境调查数据,分析了整体与山东近海3个不同海域的物种数、辛普森多样性 (Simpson’s index of diversity)、香农·威纳多样性指数 (Shannon-Wiener index of diversity)、皮尔洛均匀度 (Pielou Evenness Index)等物种多样性指数的空间分布,利用随机森林算法评估了多样性指数与环境因子所构建模型的拟合优度并且探究两者间的依存关系,研究将山东近海分成3个区域并将分区作为空间因子加入到算法模型中。显示,山东近海的多样性水平空间分布上呈现半岛南部海域高于北方的烟威渔场及其临近海域、莱州湾渔场的趋势。物种数的模型拟合效果较好,方差解释率达到77.46%,而对均匀度指数的拟合效果较差。研究表明,无论整体海域的模型还是分区模型,海底温度、海底盐度以及海水深度3种环境因子都是对多样性指数最为显著的影响因子,其中水深与海底温度在一定区间内与各个多样性指数间都存在显著正相关性;物种数随海底盐度的升高而升高,2种多样性指数随盐度变化不明显,而离岸距离与均匀度指数呈负相关关系。
草鱼C5a、C5aR和FⅡ多克隆抗体的制备与表达特性
苏杭, 肖调义, 许宝红, 刘巧林, 吕丽刚, 刘益
 doi: 10.11964/jfc.20211113169
[摘要](68) [HTML 全文](26) [PDF 4632KB](2)
摘要:
为研究草鱼补体蛋白5a (complement component 5a,C5a)、补体蛋白5a受体 (C5a receptor,C5aR) 和凝血因子Ⅱ (blood coagulation factor Ⅱ,FⅡ)在感染草鱼呼肠孤病毒 (grass carp reovirus,GCRV)时的蛋白表达和相互作用,针对草鱼C5a和FⅡ蛋白构建了原核表达体系、针对草鱼C5aR蛋白构建C5aR-KLH偶联物,纯化蛋白,免疫日本大耳白兔制备3种蛋白的多克隆抗体。用蛋白质印迹(Western blot)、免疫共沉淀 (Co-IP)和拉下 (pull down)实验检测3种蛋白表达与互作关系,Western blot结果显示,C5a和C5aR在健康草鱼的肝脏、脾脏、肾脏、头肾、肠、鳃和肌肉中均有蛋白表达,FⅡ在肝脏、脾脏和肠中表达,而在肾脏、头肾、鳃和肌肉中不表达;在感染GCRV的草鱼肝脏组织中C5a、C5aR和FⅡ蛋白均随病程进展呈现上升趋势。Co-IP结果显示,在GCRV处理后,C5a、C5aR和FⅡ蛋白具有相互作用关系。pull down结果显示,C5a pull down共鉴定得到C3、RIG-I等28种候选蛋白,C5aR pull down共鉴定得到转醛醇酶、巨球蛋白等24种候选蛋白。该研究为深入探讨C5a、C5aR和FⅡ互作调控关系以及进一步探索补体和凝血级联系统中3个关联蛋白响应GCRV感染的作用机制奠定了基础。
胆汁酸对齐口裂腹鱼幼鱼脂肪沉积、脂肪代谢酶活性及相关基因表达的影响
向枭, 曾本和, 王睿, 许耀升, 周兴华, 陈建, 李代金, 朱成科, 林仕梅
 doi: 10.11964/jfc.20210712968
[摘要](30) [HTML 全文](4) [PDF 1272KB](0)
摘要:
为探讨饲料胆汁酸水平对齐口裂腹鱼幼鱼生长、脂肪沉积、脂肪代谢及相关基因表达的影响;实验以360 尾初始体质量为( 12.74±0.14) g 的健康齐口裂腹鱼幼鱼为对象,随机分为4 组,每组设3个重复组,每个重复组放养30 尾试验鱼,分别投喂添加0、75、150 和300 mg/kg 胆汁酸的4 种试验饲料,养殖时间为70 d。结果显示, 随着胆汁酸水平的升高,齐口裂腹鱼的增重率(WGR)呈先升高后降低的变化趋势,且在胆汁酸水平为150 mg/kg时达到最大,为226.63%;其肠脂肪酶(LPS)、肝酯酶(HL)、脂蛋白脂酶(LPL)和总脂酶(TL)活性均呈先升高后趋于稳定的变化趋势;而脂肪酸合成酶(FAS)活性则呈相反的变化趋势;齐口裂腹鱼肝脏LPL mRNA表达量则呈先上调后趋于稳定的变化趋势,FAS mRNA表达量呈先下调后趋于稳定的变化趋势;试验鱼肝脏、肌肉及全鱼中粗脂肪含量均随胆汁酸添加水平的升高呈先降低后趋于稳定的变化趋势(P<0.05),随胆汁酸添加水平对试验鱼的成活率及脂肪沉积效率无明显影响。研究表明,本试验条件下,添加适量的胆汁酸可有效上调齐口裂腹鱼LPL mRNA的表达量,下调FAS mRNA的表达量,增强脂肪代谢酶活性,促进对饲料脂肪的消化和利用,降低脂肪沉积,保护肝脏健康。
大黄鱼肿瘤抑制因子cylindromatosis (LcCYLD)的序列与免疫反应特征及其功能
张萌, 罗云江, 姚翠鸾
 doi: 10.11964/jfc.20210412738
[摘要](75) [HTML 全文](27) [PDF 2950KB](0)
摘要:
为研究大黄鱼肿瘤抑制因子cylindromatosis (CYLD)在免疫反应中的作用,本实验克隆了大黄鱼CYLD的全长cDNA (命名为LcCYLD)并对其进行序列分析;采用实时荧光定量PCR (qPCR)的方法对大黄鱼各组织及免疫刺激后的大黄鱼肾细胞系中的LcCYLD表达变化进行检测;构建了重组表达载体pTurboGFP-CYLD及pcDNA3.1-CYLD,分别用于亚细胞定位实验及过表达实验;在HEK293T细胞系中过表达LcCYLD后采用双荧光素酶报告系统检测了NF-κBTNF-αIL-1β启动子活性的变化。结果显示,LcCYLD的ORF包含2 754 bp,编码917个氨基酸,推测具有保守的3个N端的CAP-GLY结构域,1个磷酸化区域和1个C端的UCH结构域,多序列比对结果显示各物种CYLD间高度保守;系统进化分析显示,LcCYLD与来源于其他硬骨鱼的CYLD聚为一支,其中与条纹狼鲈的CYLD关系最近;转录水平表达分析发现,LcCYLD在大黄鱼各组织均有表达,其中在脑中表达量最高;LPS及poly I:C刺激能够显著诱导LcCYLD的表达;亚细胞定位实验表明LcCYLD在细胞质及细胞核中均有表达;过表达LcCYLD能够显著抑制NF-κB及促炎细胞因子TNF-αIL-1β的转录激活。以上研究结果表明,大黄鱼CYLD能够抑制NF-κB的转录激活,为深入了解LcCYLD在大黄鱼先天免疫信号转导中的作用奠定基础。
高植物蛋白饲料中添加蛋白酶对克氏原螯虾生长、免疫力及消化力的影响
杨文秀, 陈效儒, 文华, 吴凡, 胡伟, 郜卫华, 田娟, 袁汉文, 徐树德
 doi: 10.11964/jfc.20210712939
[摘要](17) [HTML 全文](4) [PDF 1785KB](0)
摘要:
为探讨低鱼粉高植物蛋白饲料中蛋白酶的适宜添加范围,在克氏原螯虾基础饲料中分别添加0、0.1、0.2、0.4、0.8、1.6 g/kg蛋白酶,制作成6组饲料。选择初始体质量为(8.18±0.11) g的克氏原螯虾,随机分为6组,每组3个重复,每个重复15尾虾,在室内养殖桶中饲养8周。结果显示,随饲料蛋白酶添加量的增加:①各组间存活率、肝体比、腹部含肉率均无显著差异;增重率和特定生长率均先升高后降低,且在蛋白酶添加量为0.2 g/kg时达到最大值。当蛋白酶添加量为0.4 g/kg时饲料系数最低;蛋白质效率和蛋白质沉积率分别在添加量为0.4和0.2 g/kg时达到最高值。经折线回归分析,增重率、饲料系数、蛋白质效率分别在蛋白酶添加量为0.16、0.24、0.23 g/kg时有最佳值。②腹部肌肉和全虾粗蛋白质含量先升高后降低最终趋于平稳,均在0.2 g/kg组有最大值。③肠道及肝胰腺蛋白酶、脂肪酶、淀粉酶活性均先增加后缓慢降低,均在0.2 g/kg组出现最大值,且显著高于对照组。④血清总蛋白含量在0.4 g/kg组出现最大值;谷草转氨酶及谷丙转氨酶活性先降低后增加,均在0.4 g/kg时出现最小值;碱性磷酸酶和酸性磷酸酶活性则先增加后降低,分别在0.2和0.4 g/kg时达到最大值;当蛋白酶添加量为0.2 g/kg时,丙二醛含量有最小值。⑤肝胰腺碱性磷酸酶和酸性磷酸酶活性先增加后降低,当蛋白酶添加量为0.2 g/kg时有最大值,且显著高于对照组。研究表明,本实验条件下克氏原螯虾饲料蛋白酶添加量为0.16~0.40 g/kg时,可提高其对植物蛋白的利用率。
洪湖碘泡虫在发病和隐性感染异育银鲫组织器官中的分布
杨坤, 翟凯旋, 习丙文, 陈凯, 谢骏
 doi: 10.11964/jfc.20201012446
[摘要](52) [HTML 全文](13) [PDF 6959KB](0)
摘要:
为探究洪湖碘泡虫在被感染异育银鲫不同组织器官中的分布及不同感染阶段的差异,实验采用显微镜镜检、PCR检测及组织病理切片相结合手段,对发病异育银鲫及隐性感染异育银鲫的肌肉、伪鳃、鳃、头肾等11个组织器官进行了广泛检测分析。显微镜镜检发现,在发病鱼的咽、伪鳃和鳃能观察到孢囊或成熟孢子;在隐性感染异育银鲫的咽上壁与副蝶骨间结缔组织、伪鳃及其血管周边观察到大量棕黄色结节,并含有洪湖碘泡虫的成熟孢子。不同组织器官DNA样品PCR检测发现,在发病鱼除肌肉外的其他10个组织器官中均检测到洪湖碘泡虫存在,其中伪鳃检出率最高 (100%);隐性感染异育银鲫在咽上壁组织、伪鳃、头肾、体肾、脾脏及卵巢中检出洪湖碘泡虫,伪鳃检出率也为最高 (26.7%)。组织病理切片显示,发病鱼咽上壁内分布着大量蜂巢状孢囊及成熟孢子,伪鳃被严重侵占和破坏;残存伪鳃鳃丝周边能观察到增殖和发育阶段的孢子生成细胞。综上所述,本研究首次报道了洪湖碘泡虫在发病和隐性感染异育银鲫不同组织器官中的分布差异,发现伪鳃可能是洪湖碘泡虫寄生和发育成熟的重要器官。结果为洪湖碘泡虫病的准确检验检疫和进一步开展致病机制研究奠定基础。
鱼类黏膜层微生物研究进展
张艳敏, 杨国坤, 李克克, 孟晓林
 doi: 10.11964/jfc.20210512856
[摘要](26) [HTML 全文](4) [PDF 1412KB](0)
摘要:
鱼类黏膜层(主要为皮肤、鳃、肠道等部位)及其共生微生物在调节鱼类黏膜层微环境稳态、促进鱼体健康方面发挥重要作用。近10年来,鱼类肠道黏膜层微生物因其在鱼体营养和健康方面具有重要作用而备受关注,而人们对于其他部位黏膜层(如皮肤、鳃)共生微生物的研究却相对滞后。为更好地了解鱼类黏膜层微生物与鱼体健康的关系,本文将结合近年来的研究结果,对鱼类黏膜层微生物的群落特征、与宿主的相互作用、影响因素、研究策略和应用价值等方面对鱼类黏膜层微生物的研究现状和存在问题进行综述,旨在为鱼类黏膜层微生物未来研究的发展方向,及其在生产、实践方面的应用提供理论参考。
马鞍列岛东部海域小黄鱼时空分布特征
汪振华, 沈慧, 林军, 章守宇, 钟佳明, 陈奕帆, 刘章彬
 
[摘要](41) [HTML 全文](25) [PDF 3324KB](0)
摘要:
鱼类在不同生活史阶段往往表现出不同的生境偏好,对这种规律的全面认知是进行资源保护、海洋牧场增殖目标种选择以及增殖技术研发的前提。实验基于2016年夏季 (8月)、秋季 (12月)和2017年冬季 (3月)、春季 (5月)在马鞍列岛东部海域19个站点的底拖网调查数据,应用资源密度、相对重要性指数以及GIS空间分析方法,对3496 inds小黄鱼样品年龄、性别、性成熟度和饵料组成等生物学参数及其时空分布进行了统计分析,并结合回归分析探讨了小黄鱼生物学指标与环境因子之间的关系。结果显示,研究海域小黄鱼种群存在较强的季节变动和空间差异:平均资源密度夏季最高,冬季最低;夏季资源密度岛礁内水域远高于岛礁外围。年龄结构上除了夏季以幼鱼为主 (75.7%)外,其他季节皆以1龄鱼为主。岛礁内部水域夏季小黄鱼饵料生物丰富度显著高于岛礁外,春秋季相反。与环境因子的回归分析结果显示,岛礁外最显著的影响因子为浮游植物丰度,该值越高则小黄鱼资源密度越高,但岛礁内部分布上并未显示出与任一环境因子的显著相关性。研究表明,岛礁繁多且规模化人工生境的存在使马鞍列岛东部海域成为小黄鱼优良的索饵避敌与栖息繁殖场所。除了饵料因素外,岛礁内的小黄鱼并未对具体的环境因子产生明显趋向性,但对岛礁内各环境要素构成的生境却显示出一定的偏好。
鳜肤孢虫新种的分离和鉴定
张波, 顾泽茂
 doi: 10.11964/jfc.20210312707
[摘要](70) [HTML 全文](36) [PDF 3552KB](1)
摘要:
为准确鉴定鳜肤孢虫病的病原,实验基于形态学比较,结合寄生特征分析和分子系统学方法开展研究,并观察超微结构。形态学观察结果显示,纺锤形或哑铃形白色孢囊,长约1.9~6.8 mm,寄生于鳍条、皮肤、口腔、鳃盖内外表面和鳃丝;圆形内生孢子,直径约 (9.8±1.8) (7.3~13.8) μm;孢子内环状细胞质和直径约 (6.5±1.2) (3.9~8.3) μm的圆形折光体,鉴定其为肤孢虫。该物种测量值区别于其他肤孢虫,与寄生于鳜鳃的未定种 (HB)测量值基本一致;与广东省和河南省的鳜源鳗鲡肤孢虫 (GD和HN)以及HB寄生于相似部位。分子序列比对和系统发育结果显示,该物种与GD、HN、芬兰肤孢虫、鲑肤孢虫和寄生美洲鳗鲡的鳗鲡肤孢虫序列的一致性大于99%;与GD和HN的亲缘关系最近,与鲑肤孢虫次之,与芬兰肤孢虫和鳗鲡肤孢虫的亲缘关系较远。综上,该物种与已报道的寄生与鳜的肤孢虫为同种,并修订寄生鳜的鳗鲡肤孢虫的GD和HN分离株记录;将本研究肤孢虫和HB、GD和HN分离株一同命名为鳜肤孢虫 (Dermocystidium sinipercae sp. n.),新种。鳜肤孢虫种内形态差异可能与采样时间和发育阶段有关;孢子增殖分化过程在超微结构观察中被记录和描述。本研究证实鳜肤孢虫已于我国多地分布,强调鳜产地检疫措施亟待落实。
乌鳢诺卡氏菌病致病菌的分离、鉴定及组织病理学观察
滕建, 陈红菊, 薛良义, 李岩, 路广金, 周敏, 张冲, 季相山
 doi: 10.11964/20201212535
[摘要](78) [HTML 全文](41) [PDF 3844KB](0)
摘要:
为研究乌鳢诺卡氏菌的致病机理,本实验通过病原分离鉴定、组织病理学和基因表达水平分析对病原菌的致病性、药物敏感性及乌鳢的免疫抗性进行了研究。结果显示,患病乌鳢主要感染了命名为SDAT 0011病原菌,通过菌落形态观察、革兰氏染色鉴定、生理生化鉴定、16S rRNA鉴定及诺卡氏菌特异序列扩增鉴定,结果均显示该病原菌为诺卡氏菌。将分离的SDAT 0011感染健康乌鳢后,1 × 105~1 × 108 CFU/mL注射组的死亡率均为100%,感染乌鳢出现明显的诺卡氏菌病症状,如内脏出血,肝脏、脾脏和肾脏中有大量大小不等的结节,组织病理切片进一步检测发现,结节分界清晰,结节中有大量的淋巴细胞、受损或死亡的组织细胞。药物敏感性实验发现,诺卡氏菌对利福平等抗生素较为敏感,对青霉素等具有较强的抗性。基因表达分析显示,在感染初期 (48 h)及中后期,Toll样受体2基因 (TLR2)和Toll样受体13基因 (TLR13)在脾脏和头肾的表达水平显著上调,而趋化因子受体9基因 (CCR9)在脾脏和头肾中显著下调,这表明乌鳢Toll样受体和趋化因子受体信号通路可能在其抵抗诺卡氏菌感染中起重要作用。本实验为乌鳢诺卡氏菌病的治疗及其致病机理研究提供了重要的基础。
17β-HSDs的种类和功能概述及其在贝类中的研究进展
曾臻, 余美舜, 谭强来, 史博, 李建波, 李伟杰, 蔡广
 doi: 10.11964/jfc.20201112505
[摘要](59) [HTML 全文](33) [PDF 1407KB](0)
摘要:
为深入解析17β-HSDs (17β-羟基类固醇脱氢酶)对贝类性腺发育和生殖内分泌的调控机制,本文综述了17β-HSDs的种类和功能,对迄今已报道的所有亚型进行了分类归纳,并对贝类等水产动物中17β-HSDs的克隆表达、功能阐述、机制推测进行了调研总结。目前,虽然17β-HSDs调控贝类生殖过程研究已取得一定的进展,但仍有很多重要的科学问题尚待解答,需要重点加强“发现贝类中17β-HSDs新亚型、分析时空表达特征、解析构效关系、明晰环境污染物的影响、制定相应对策、指导产业实践应用”等方面的研究。本综述结合了其他物种的成熟研究和最新成果,为深入探究17β-HSDs调控贝类性腺发育和生殖内分泌的机理及应用提供了借鉴。
长牡蛎和福建牡蛎个体生长模型的构建及比较
姜娓娓, 蔺凡, 曾志南, 宁岳, 杜美荣, 房景辉, 高亚平, 方建光, 蒋增杰
 doi: 10.11964/jfc.20201012456
[摘要](43) [HTML 全文](8) [PDF 1524KB](0)
摘要:
长牡蛎和福建牡蛎分别是我国北方和南方沿海重要的养殖贝类。为比较分析二者的动态生长情况,实验基于动态能量收支理论 (DEB),以连续监测的水温和叶绿素a浓度为强制因子,通过现场实验、模型调试和文献查阅等方式获取模型参数,利用Python 2.7软件分别构建了桑沟湾长牡蛎、深沪湾福建牡蛎的个体生长模型,并以两种牡蛎的实测生长数据进行验证。结果显示:①所构建的DEB模型能够较好地模拟长牡蛎、福建牡蛎的个体生长情况 (壳高、软组织湿重等),模拟值与实测值之间相关性显著;②长牡蛎和福建牡蛎的温度耐受上限 (TH)、温度耐受下限 (TL)、半饱和常数 (FH) 等参数存在差异,这可能与不同海域的理化环境、食物组成及牡蛎的选择性摄食有关;③在模拟周期内,受温度和食物的双重限制,长牡蛎冬季生长缓慢,而福建牡蛎处于持续增长状态,期间主要受到食物的限制。本研究结果可为后续生态系统模型构建和牡蛎养殖容量评估提供基础数据。
筏式养殖虾夷扇贝“褐色沉积症”形成原因初步研究
于佐安, 李大成, 王庆志, 李华琳, 于笛, 刘项峰, 滕炜鸣, 王笑月, 周遵春
 doi: 10.11964/jfc.20200912413
[摘要](31) [HTML 全文](8) [PDF 1977KB](0)
摘要:
为分析筏式养殖虾夷扇贝贝壳内侧褐色沉积症状形成机制,讨论虾夷扇贝夏季大规模死亡和褐色沉积症状相关性。2017—2019年的3—10月开展流行病学调查,调查虾夷扇贝褐色沉积症症状发生过程和出现比例,统计虾夷扇贝累积死亡率。设计防咬合扇贝养殖笼,统计褐色沉积症扇贝出现比例。利用傅里叶红外光谱分析法分析褐色沉积物质成分,讨论内在形成原因。 结果显示,防咬合扇贝养殖笼内养殖扇贝累积死亡率为87.6%,褐色沉积症状出现比例为74.5%,扇贝间咬合导致的损伤不是褐色沉积症出现的原因。褐色沉积物质红外光谱谱型与牛血清白蛋白粉末谱型一致,且具备蛋白质特征峰酰胺Ⅰ带和酰胺Ⅲ带,揭示贝壳内侧褐色沉积物质主要成分为蛋白质。虾夷扇贝褐色沉积症出现时间具有规律性,6月中下旬出现症状后持续至8月份,与扇贝开始死亡时间吻合。2017—2019年褐色沉积症状比例为85.7%、1.54%和10.9%,扇贝累积死亡率分别为90.4%、49.2%和48.16%,和筏式养殖虾夷扇贝夏季死亡具有相关性 (r=0.992),其形成原因可能与病原感染相关。
红螯光壳螯虾响应长期水体盐度胁迫的基因和代谢通路
刘树彬, 徐畅, 贾永义, 顾志敏, 李二超
 doi: 10.11964/jfc.20200912412
[摘要](22) [HTML 全文](7) [PDF 2040KB](0)
摘要:
为探究长期盐度胁迫条件下红螯光壳螯虾肠道基因表达和代谢通路的变化。实验采用Illumina Hiseq 2500平台对0、5、10和15 4个盐度下养殖5周的红螯光壳螯虾的肠道组织进行了高通量测序。研究共获76 534个unigenes,通过与NR、NT、KO、Swissprot、PFAM、GO和KOG数据库进行比对,成功注释37 378个unigenes。通过引入FPKM (Fragments Per Kilo bases per Million fragments)来估算基因表达水平,基于NR和Pfam两个数据库的蛋白注释结果,448 362个unigenes在GO数据库得到注释。根据KO功能注释与Pathway的联系,9 483个unigenes在KEGG数据库被注释分类到34条通路途径。通过DEGseq进行基因表达差异分析,以盐度0为对照组,显著差异基因筛选条件设置为Q value<0.05且差异倍数|Fold Change|>2,盐度5、10和15组分别获得差异基因2 733、91和236个,其中盐度5组共有2 068个基因显著上调,665个基因显著下调。将所有差异表达基因进行KEGG通路富集分析,盐度5、10和15组分别富集到265、80和120条通路,仅有盐度10和15组分别有一条显著富集的通路,均为军团杆菌病通路。经过鉴定,军团杆菌病通路显著下调,这与团队已有研究肠道菌群研究结果一致。表明红螯光壳螯虾在盐度胁迫下,可通过抑制潜在病原菌相关通路以及丰度,达到保护肠道避免外环境病原菌侵染的效果。此外,eEF1αudpUPPACTB_G1、TUBATUBBPFNCALM等差异基因的变化说明盐度升高可显著影响红螯光壳螯虾肠道的细胞形态、细胞内物质运输和细胞内信号转导途径,但红螯光壳螯虾启动嘧啶补救合成途径可以修复尿嘧啶核苷酸比例失衡导致的遗传损伤。研究结果可为红螯光壳螯虾的半咸水养殖提供重要的理论支持,同时也可为深入研究红螯光壳螯虾盐度胁迫下的肠道免疫调控机制提供参考。
嗜水气单胞菌刺激下鲤血清质子转运载体15a2 (Slc15a2)的表达分析
姜洲, 薛亚果, 张猛, 朱雷, 王磊, 李学军, 董传举
 doi: 10.11964/jfc.20201112509
[摘要](69) [HTML 全文](30) [PDF 1827KB](3)
摘要:
为解析鲤质子转运载体15a2 (Slc15a2)在嗜水气单胞菌侵染过程中对机体免疫应答机制的影响,实验通过制备鼠源Slc15a2-1和Slc15a2-2多克隆抗体,采用酶联免疫吸附测定 (ELISA) 技术检测嗜水气单胞菌感染后鲤血清中Slc15a2-1和Slc15a2-2蛋白表达变化。结果显示,①感染后2个拷贝的最高蛋白表达水平与空白对照组相比,分别增加了4.81和2.48倍;与Slc15a2-1相比Slc15a2-2的表达量从0~48 h一直处于较高表达水平。②从整体来看,Slc15a2的2个拷贝具有相似的表达趋势,均为先升高后降低、再升高再降低;但Slc15a2-1在3 h达到第1个表达高峰,而Slc15a2-2则在6 h达到第1个表达高峰。③ 6~24 h的4个时期中,Slc15a2-1和Slc15a2-2蛋白表达呈现互补的表达趋势,即在同一时期一个拷贝的表达量显著下降,另一个拷贝的表达量显著升高,但总体维持较高表达水平。结果表明,本实验制备的鼠源Slc15a2-1和Slc15a2-2多克隆抗体具有较高的亲和力和特异性,当鲤受到嗜水气单胞菌侵染后,2个拷贝整体具有相似的表达趋势,说明可能具有相似的基因功能;与Slc15a2-1相比,Slc15a2-2在0~48 h之间具有显著的高表达量,推测该基因为2个拷贝中的主效基因,并且6~24 h时,2个拷贝一直呈现互补的表达方式,导致Slc15a2表达量维持在高水平,面对病原侵害时能做有效响应。本研究为深入了解鲤Slc15a2的免疫防御机制提供一定的研究基础。
基于人工神经网络的日本海舍氏贝乌贼角质颚色素沉积特性分析
朱文斌, 陈炫妤, 陆化杰, 陈子越, 宁欣, 崔国辰, 郭爱, 陈新军
 doi: 10.11964/jfc.20201112472
[摘要](42) [HTML 全文](24) [PDF 1023KB](0)
摘要:
根据中国鱿钓船于2018年12月在日本海采集的303尾舍氏贝乌贼样本,进行基础生物学分析,对其角质颚色素沉积等级进行划分和判定,利用人工神经网络模型分析了色素沉积等级与胴长、体质量、性腺成熟度、角质颚形态参数和胃级的关系,并对各生长因子的中位数进行了线性拟合。结果显示,胴长对角质颚色素沉积的贡献率最大,为22.9%,其次分别为下头盖长、性腺成熟度、体质量、下喙长和下翼长,贡献率分别为16.5%、14.4%、11.9%、11.7%和11.6%,下侧壁长和胃级对角质颚色素沉积的贡献率较小,分别为6.3%和4.7%。舍氏贝乌贼角质颚的色素沉积与胴长、体质量、性腺成熟度和胃级这4项生长因子的关系均不存在性别间显著性差异。角质颚色素沉积等级与胴长、体质量和角质颚外部形态参数均呈正相关,并随着性腺成熟度的增加而增加,但与胃级的线性关系不明显。研究表明,日本海舍氏贝乌贼角质颚色素沉积等级与胴长、性腺成熟度、体质量和角质颚形态参数均呈正相关关系,可以利用胴长、性腺成熟度、体重和角质颚形态参数预估色素沉积等级。
缢蛏过氧化氢酶基因的克隆及其功能
乔晓静, 张卫卫, 邵铱娜, 赵雪琳, 李成华
 doi: 10.11964/jfc.202110112603
[摘要](16) [HTML 全文](6) [PDF 11613KB](1)
摘要:
过氧化氢酶(catalase, CAT)是抗氧化酶体系的主要成员,在维持机体氧化还原平衡、抵御病原感染过程中具有重要作用。为研究CAT基因在软体动物应答病原胁迫过程中的作用,实验采用RACE技术通过克隆和序列拼接获得了缢蛏CAT基因的全长cDNA序列,并命名为ScCATScCAT基因全长为2840 bp,编码508个氨基酸。序列分析显示,ScCAT蛋白含有1个CAT核心结构域(25-410),1个保守的酶活性位点(61FNRERIPERVVHAKGAGA78)和1个亚铁血红素结合位点(351RLFSYPDTH359)。多序列比对和系统进化树分析结果显示,ScCAT属于CAT基因家族,且与无脊椎动物文蛤的亲缘关系最近。组织分布显示,ScCAT在所有检测的组织中均能表达,其中在肝胰腺中表达量最高,鳃中次之,血细胞中的表达量最低,分别为闭壳肌的85.67倍、50.09倍和0.76倍。副溶血弧菌胁迫下,ScCAT在缢蛏肝胰腺中的表达明显上升,且在12 h达到最高值,为对照组的3.56倍;酶活性测定结果显示,副溶血弧菌胁迫显著诱导缢蛏肝胰腺和鳃组织中的CAT活性。为进一步探讨ScCAT的蛋白功能,构建ScCAT原核表达质粒,通过诱导、纯化后发现ScCAT重组蛋白具有显著的CAT酶活性。研究表明,ScCAT作为一类重要的抗氧化酶参与了缢蛏体内的免疫应答。
南沙群岛重点岛礁潟湖微型浮游动物的群落结构与摄食
赵常升, 刘永, 肖雅元, 谢志超, 王学锋, 李纯厚
 doi: 10.11964/jfc.20200712344
[摘要](34) [HTML 全文](16) [PDF 2060KB](0)
摘要:
潟湖是岛礁生物多样性演变的重要环境场,在岛礁水生态系统的物质循环和能量流动中发挥重要作用,而微型浮游动物的生态功能研究是解析南沙群岛岛礁水域潟湖生态系统初级生产力组成、流向、能量流动效率的重要研究内容之一。实验通过对南沙群岛重点岛礁渚碧礁、美济礁与永暑礁潟湖表层水域中微型浮游动物与生态环境调查,研究了其群落结构及其与环境因子的关系,并通过稀释培养实验研究了微型浮游动物的摄食压力。结果显示,调查水域共发现微型浮游动物20种,总丰度的范围为320~1460个/L,以无壳纤毛虫丰度最高。无壳纤毛虫在渚碧礁潟湖西部水域(ZB-1)丰度最高,砂壳纤毛虫峰值则出现在永暑礁潟湖中部水域(YS-3),桡足类幼体丰度最大值出现在美济礁潟湖北部水域(MJ-2)。聚类分析结果显示,3个岛礁潟湖中部区域的微型浮游动物群落相似度较高,溶解氧是影响群落结构的最重要因素,特别是对MJ-3站位影响最为突出。摄食实验结果显示,3个岛礁潟湖水域浮游植物生长率为0.22~1.36 d−1;微型浮游动物摄食率范围为0.22~0.60 d−1,微型浮游动物每天约摄食浮游植物现存量的20.5%~45.1%,相当于初级生产力的37.1%~222.9%。研究表明,南沙群岛3个岛礁不同的环境和生物因子共同影响着潟湖内微型浮游动物的摄食压力,从而使3个岛礁形成了不同的微型浮游动物生物多样性演化机制或方向。
热应激对大菱鲆心肌损伤及细胞凋亡的影响
郭晓丽, 黄智慧, 马爱军, 王庆敏, 徐荣静, 李明, 陈志信
 doi: 10.11964/jfc.20201112492
[摘要](42) [HTML 全文](12) [PDF 5203KB](0)
摘要:
大菱鲆作为一种低温冷水性经济鱼类,高温环境严重影响其生长和生存,学者证实心脏功能是设定鱼类上限热范围的重要因素。为解析热应激对大菱鲆心脏损伤及其机制,从组织形态、生理生化反应及凋亡基因表达等多个水平,分别使用H.E染色法、电镜观察法、酶活检测法、qPCR检测基因表达法开展了本研究。结果显示,随着温度升高,心肌纤维肿胀,断裂,间质宽度增加,炎性细胞浸润,线粒体结构破坏等组织损伤现象加重,但在24 °C-24 h时组织损伤明显减轻;CK活性随着热应激加剧显著升高;LDH、SOD活性,MDA含量在24 °C时达到峰值,表明大菱鲆遭受到热应激,心肌防御酶发挥抵抗作用,维持机体稳态。qPCR显示,大菱鲆心肌细胞 Bax 基因和Caspase-3基因变化趋势一致,随着热应激的加剧,表达量降低,而Bcl-2基因逐渐升高;表明在热应激程度较轻时,大菱鲆心肌通过降低Bax、Caspase-3基因表达,促进抗凋亡基因Bcl-2的表达,减少心肌细胞丢失来减少热应激损伤;当热应激加剧至28 °C时,热应激超过自身生理调节阈值,损伤加重,机体防御系统自身也受损,造成大菱鲆心脏结构严重损伤甚至机体死亡。研究表明,随着温度升高,大菱鲆心肌损伤加重,机体通过调节心肌防御酶活性以及细胞凋亡,最大限度维持稳态,减少组织损伤。超过24 °C时,则会造成机体损伤不可逆转地持续加重。本研究为后续大菱鲆及其他鱼类心脏对热应激的生理适应性机制研究提供理论基础,同时为海洋鱼类耐高温性状选育提供更多的性状指标,提高选育精确性。
刀鲚基因家族鉴定及扩张与收缩
张金鹏, 高淑芳, 施永海, 严银龙, 齐明, 刘其根
 doi: 10.11964/jfc.20201112478
[摘要](51) [HTML 全文](16) [PDF 3627KB](0)
摘要:
为增加对刀鲚在进化过程中因核心基因家族改变而产生的特殊机制的了解。研究利用比较基因组学,通过比较刀鲚及其近缘物种斑马鱼、三刺鱼、青鳉、红鳍东方鲀和绿河鲀基因组,鉴定刀鲚基因家族;利用CAFÉ v 4.2软件进行基因家族扩张和收缩分析;最后将鉴定的扩张基因家族基因与GO、KEGG等数据库进行比对、注释和通路分析。结果显示,刀鲚具有11 872个基因家族,包含16 470个基因,有2 963个基因未形成基因家族。同其他5个物种相比,刀鲚有150个特有基因家族,包含419个基因。刀鲚扩张和收缩基因家族分析结果表明,刀鲚有1 200个基因家族扩张了,7 543个基因家族收缩了。刀鲚显著扩张的基因家族有39个,包含508个基因;显著收缩的基因家族有36个,包含21个基因。刀鲚显著扩张基因家族GO富集分析条目中鉴定较多的是,代谢过程、催化活性、细胞、细胞组分等。KEGG富集分析条目中鉴定较多的是紧密连接、心肌细胞的肾上腺素能信号、心肌收缩、细胞黏附分子等。与渗透压调节相关的通路有紧密连接、心肌收缩等;与生殖洄游行为相关的通路有GnRH信号通路、嗅觉转导通路等。对显著扩张基因家族基因进行基因组定位,结果显示23号染色体上基因数目显著多于其他染色体。定位在23号染色体的基因多为组蛋白基因,其功能与染色质结构调控有关。研究表明,刀鲚渗透调节、信号转导、代谢、性腺发育和嗅觉等方面均可能产生了适应性进化,且其染色质结构调节也可能发生改变。
黄岛近海岸贝类养殖区细菌群落结构多样性及环境因子
马景雪, 张培玉, 王宗兴, 郑明刚, 高萍, 曲凌云, 郑风荣
 doi: 10.11964/jfc.20201012450
[摘要](49) [HTML 全文](10) [PDF 3075KB](0)
摘要:
为了研究近海贝类开放养殖水域中细菌种群分布规律以及微生物群落多样性对环境因子的响应及与水产动物发病的关系,本实验于2019年7—11月采集黄岛某开放养殖水域不同样点海水样本,分析不同水质因子(水温、盐度、pH、DO、叶绿素a、氨氮、磷酸盐、硝酸盐和亚硝酸盐)的动态变化,并利用高通量测序的方法分析了不同月份水样和栉孔扇贝组织样本微生物群落结构和多样性的差异,探讨了环境因子与微生物群落结构的相关性。结果显示,水样本细菌群落结构共检测到42个门,94个纲。由变形菌门、拟杆菌门、蓝细菌门、放线菌门及厚壁菌门等组成,其中变形菌门为优势菌门,主要包括γ-变形菌纲和α-变形菌纲。不同月份,细菌OTU水平多样性分析结果为11月>9月>7月>10月>8月;弧菌OTU水平多样性分析结果显示,弧菌的多样性呈现先升高后降低的变化,与水温的变化趋势一致,8月养殖区多样性高于对照区。RDA分析表明,叶绿素含量 (μg/L)和亚硝酸盐的浓度 (mg/L)对门水平的物种组成和群落结构具有显著的影响。磷酸盐含量 (mg/L)和DO (mg/L)对弧菌属水平的群落结构具有显著影响。扇贝组织样本细菌群落结构共检测出45个门,软壁菌门为优势菌门,主要包括支原菌属,与磷酸盐含量 (mg/L)具有显著正相关。弧菌优势菌分离鉴定结果显示,7—11月养殖环境中的优势菌为溶藻弧菌和哈维氏弧菌。研究表明,养殖活动通过改变水体中的叶绿素和亚硝酸盐的含量,对水体中的微生物群落结构产生了一定的影响,同时磷酸盐和DO的变化对弧菌属水平的群落结构也产生了一定的影响。本研究结果可为贝类疾病的发生提供一定的理论支撑。
凡纳滨对虾丝氨酸蛋白酶同源物基因 (Lv-SPH)的克隆及免疫应答特征
尹丝雨, 何雨欣, 于娇, 刘逸尘, 张亦陈, 耿绪云, 孙金生
 doi: 10.11964/jfc.20211213249
[摘要](81) [HTML 全文](25) [PDF 3662KB](1)
摘要:
丝氨酸蛋白酶 (SP)是一类分布广泛的蛋白水解酶,行使着一系列重要的生理功能,包括参与消化作用、血液凝结、胚胎发育和免疫应答过程等,但在甲壳动物中仅见初步报道。对虾的养殖持续面临着病害的困扰,深入开展对虾免疫防御机制研究,将会为寻找抗病新思路提供借鉴。本研究利用RACE技术克隆获得了一个新的凡纳滨对虾丝氨酸蛋白酶同源物 (serine protease homologs, SPHs)基因 (Lv-SPH)的全长cDNA序列,通过生物信息学方法分析了其序列特点,并利用实时荧光定量PCR (qPCR)方法探讨了其组织分布特征和应答病毒感染的表达变化模式。生物信息学分析显示该基因全长1 249 bp,开放阅读框 (ORF)区长1 005 bp,5′-UTR为156 bp,3′-UTR为88 bp,ORF区编码334个氨基酸,氨基端的16个氨基酸为预测的信号肽序列。经在线分析软件SMART分析显示,Lv-SPH含有一个clip结构域和一个高度保守的SP结构域 (Tryp-SPc),后者具有3分子活性催化位点,前2个是组氨酸和天冬氨酸,第3位为甘氨酸。该基因在凡纳滨对虾各种组织中有不同程度的表达,其中在血细胞中表达量最高,在肝胰腺、心脏和肠道中广泛表达,而在肌肉中表达量最低。注射白斑综合征病毒 (WSSV)后24 h,Lv-SPH的相对表达量显著升高,病毒感染后48 h达到最高,约为对照组的3倍。Lv-SPH具备典型的SPH家族成员特征,具有一定的组织表达特异性,WSSV可以显著诱导该基因表达上调,表明其可能参与了WSSV引发的凡纳滨对虾免疫应答过程。研究结果为深入探讨对虾天然免疫调控机制提供了参考,在对虾健康养殖及病害防治方面具有潜在的应用价值。
鲍疱疹病毒原位LAMP检测方法的建立与初步应用
谷莉, 郑玉东, 张翔, 白昌明, 刘金兰, 辛鲁生, 李晨, 王崇明
 doi: 10.11964/jfc.20211013104
[摘要](43) [HTML 全文](16) [PDF 3675KB](0)
摘要:
为精确定位鲍疱疹病毒 (HaHV-1)在宿主不同组织器官中的分布,明确HaHV-1的组织亲嗜性和侵染进程,实验基于环介导等温扩增技术 (LAMP)和原位杂交技术建立了HaHV-1的原位LAMP检测方法。利用该方法研究了HaHV-1人工感染实验不同时间节点,病毒在杂色鲍主要器官的分布规律和组织亲嗜性。并对已报道的HaHV-1 LAMP扩增引物进行优化,实现对载玻片上原位固定靶组织内病毒DNA的稳定、特异扩增,筛选最佳显色时间等原位杂交反应条件,最后通过免疫酶标技术显示HaHV-1在组织样本内的分布情况。结果显示,HaHV-1原位LAMP检测方法最适显色时间为60 min。利用该方法对攻毒后24、36、48、60和72 h,HaHV-1在杂色鲍外套膜、鳃、肝胰腺和腹足神经节4种样本的组织分布情况进行检测和分析。病毒阳性信号最早于36 h出现在腹足神经节,48 h 在部分外套膜样本中观察到病毒阳性信号,分布局限于外周神经中。在感染实验后期,病毒阳性信号出现在肝胰腺结缔组织中。病毒阳性信号出现的部位常有大量细胞渗出和浸润,渗出的细胞中可见被病毒感染的血淋巴细胞。本研究建立的HaHV-1原位LAMP检测方法,同步实现了高灵敏度和精确定位的功能。该检测方法适用于病毒感染的确诊、不同组织器官的亲嗜性、病毒侵染途径和致病机理等相关研究。
维生素C碳点对水产养殖主要病原菌的抗菌性能及其生物相容性
何稳, 田丹阳, 孔令娇, 菅攀阳, 方洁, 孙丙耀, 宋学宏
 doi: 10.11964/jfc.20210612928
[摘要](87) [HTML 全文](28) [PDF 1897KB](0)
摘要:
近年来,渔用抗生素滥用带来的一系列安全问题备受关注,绿色高效抗生素替代物的开发和应用对水产养殖业的可持续发展将产生日益显著的影响。纳米材料具有广谱抗菌性能,基于纳米材料开发抗生素替代物已成为纳米技术应用研究的热点。维生素C碳点是近年来绿色合成的一类纳米材料,本研究采用3倍梯度稀释法检测了维生素C碳点对嗜水气单胞菌、副溶血性弧菌、灿烂弧菌、诺卡氏菌等12种常见水产病原菌的最小抑菌浓度和最小杀菌浓度,在此基础上,测定了其对这12种水产病原菌的抑菌动力学曲线。此外,基于纳米材料可能存在的生物相容性等问题,实验采用MTT法检测了维生素C碳点对草鱼肾细胞的细胞毒性,并以斑马鱼胚胎为测试对象,测定其经维生素C碳点暴露后的胚胎毒性。结果显示,维生素C碳点对所监测的12种水产病原菌均有显著的抑制作用,最小抑菌浓度为20.6~61.7 μg/mL,基本达到与抗生素氟苯尼考同等的抗菌作用。维生素C碳点在最小抑菌浓度范围内胚胎和细胞存活率可接近100%,与对照组无差异。研究表明,维生素C碳点对水产主要病原菌有良好的杀菌和抗菌效果,具有较好的生物相容性,在水产养殖细菌性病害防治上具有潜在的开发应用前景。
两株溶藻弧菌烈性噬菌体的分离鉴定及其生物学特性
乔欢, 陈海, 徐旭凌, 丛郁, 刘墨, 何四龙, 费文斌, 黄杰, 胡怿林
 doi: 10.11964/jfc.20210112580
[摘要](75) [HTML 全文](16) [PDF 2847KB](1)
摘要:
溶藻弧菌是海洋经济动物的主要病原菌之一。噬菌体作为一种新兴的抗细菌感染制剂,在水产养殖方面具有较大潜力。为寻找并丰富溶藻弧菌噬菌体资源,实验以溶藻弧菌VAHN1为宿主菌,采用双层平板法从海南虾塘水样及福建海产品样本中对溶藻弧菌噬菌体进行分离。通过透射电镜、限制性内切酶及构建发育树等方法对所获溶藻弧菌噬菌体进行了分类鉴定;同时对其生理生化性能进行了研究。结果显示,本研究分离获得2株溶藻弧菌噬菌体VAP9与VAP21,其噬菌斑均清晰透亮,直径约1.5~2.0 mm。2株噬菌体核酸均为双链DNA,于透射电镜下可见其头部均呈正二十面体结构,2株噬菌体均属肌尾噬菌体科。噬菌体VAP9与VAP21对理化环境具有良好的耐受性;VAP9最适pH为6~8,VAP21最适pH为7~11;2株噬菌体可耐受通用杀菌浓度的过氧乙酸,且对氯仿与乙醚不敏感,同时对紫外线具有一定耐受性。噬菌体VAP9与VAP21的最佳感染复数均为0.001;2株噬菌体对供试溶藻弧菌的裂解率达95.2%,可裂解部分副溶血性弧菌,但无法裂解除溶藻弧菌与副溶血性弧菌外的弧菌属、葡萄球菌属、假单胞菌属等其他种属的供试细菌。噬菌体VAP9与VAP21可高效抑制溶藻弧菌VAHN1的生长,且2株噬菌体的混合制剂对溶藻弧菌的抑制效果优于单株溶藻弧菌噬菌体。将噬菌体VAP9及VAP21保守蛋白序列于NCBI上比对,发现2株噬菌体与其他噬菌体间同源性较低,因此噬菌体VAP9及VAP21很可能为2株新发现的肌尾科噬菌体。
草鱼CD8αCD207基因重组真核表达质粒的构建与表达分析
田丁, 李珂珂, 蒋飞, 陈春秀, 念子清, 吴志新, 陈孝煊
 doi: 10.11964/jfc.20220113282
[摘要](43) [HTML 全文](26) [PDF 4781KB](1)
摘要:
为进一步研究CD8α、CD207在草鱼树突状细胞 (dendritic cells,DCs)中的功能,实验构建了草鱼CD8αCD207基因重组真核表达质粒并在草鱼DCs中成功表达。采用逆转录-聚合酶链式反应 (RT-PCR)技术从草鱼DCs中获得CD8αCD207开放阅读框序列 (ORF),分别插入真核表达质粒pcDNA3.1,构建重组真核表达质粒pcDNA3.1-CD8α、pcDNA3.1-CD207;经测序鉴定正确后,采用脂质体法将重组真核表达质粒分别转染至草鱼树突状细胞,经细胞免疫荧光技术和蛋白免疫印迹法验证CD8α、CD207的表达。结果显示,在蛋白免疫印迹实验 (Western Blot)中CD8α、CD207蛋白可正常表达,且大小与预测结果一致。细胞免疫荧光显示CD8α、CD207蛋白主要在草鱼DCs的细胞膜上表达。本研究成功构建pcDNA3.1-CD8α、pcDNA3.1-CD207重组真核表达质粒,为后续研究CD8αCD207基因在DCs中的作用机制奠定了基础。
尼罗罗非鱼鼠李糖凝集素 (RBL-1)在非特异性细胞防御病原菌感染中的功能
木亮亮, 白皓, 李嘉东, 邱丽, 尹晓雪, 叶剑敏
 doi: 10.11964/jfc.20211213236
[摘要](48) [HTML 全文](17) [PDF 2066KB](0)
摘要:
为了探究鼠李糖凝集素 (RBL)在硬骨鱼非特异性细胞防御病原菌感染中的作用,实验以尼罗罗非鱼为研究模型,首先通过分离头肾单核/巨噬细胞进行体外菌应激实验,结果发现,尼罗罗非鱼在2种致病菌即无乳链球菌和嗜水气单胞菌应激后,尼罗罗非鱼L-鼠李糖凝集素1基因 (Onrbl-1)的表达量显著上调。然后,通过荧光定量PCR (qRT-PCR)检测发现OnRBL-1重组蛋白能够调节病原菌诱导细胞炎症因子的表达,包括显著抑制细菌诱导的il-6、il-8和tnf-α的表达,促进il-10和tgf-β的表达。此外,通过流式细胞术检测证实OnRBL-1重组蛋白具有促进单核/巨噬细胞的吞噬作用,同时增强呼吸爆发水平和上调活性氧的释放。以上研究表明,OnRBL-1在尼罗罗非鱼单核/巨噬细胞炎症因子表达、吞噬作用、呼吸爆发和活性氧释放等非特异性细胞免疫防御中发挥调节作用。本研究为探讨RBL-1在硬骨鱼宿主防御病原菌感染中的功能提供了参考,并有助于完善和丰富硬骨鱼类RBL的功能和在抗菌免疫应答中的基础理论体系,具有重要的科学意义。
赤点石斑鱼Toll样受体 (TLRs)基因家族的鉴定、进化与表达
陈桂森, 曹贞洁, 要欣平, 魏曹莹, 孙云, 周永灿
 doi: 10.11964/jfc.20220113268
[摘要](47) [HTML 全文](15) [PDF 1870KB](3)
摘要:
为研究赤点石斑鱼Toll样受体 (TLRs)的进化、分布及表达模式,本实验基于已公开的赤点石斑鱼基因组和转录组数据,利用Blast、系统进化与共线性等生物信息学方法,分析赤点石斑鱼TLRs基因家族的系统进化、染色体分布及在各组织中的表达模式。结果显示,在赤点石斑鱼中共鉴定出17个TLR基因,这些基因分属于5个亚家族 (TLR1、TLR3、TLR5、TLR7和TLR11),分别分布在24条染色体中的11条染色体上;17个TLR基因在赤点石斑鱼不同组织中具有不同的表达模式,然而,位于相同染色体上的TLR基因的不同拷贝则存在相似的表达模式。其中EaTLR18-1与EaTLR18-2均位于9号染色体上,二者的表达模式高度相似,均在心脏中高表达;同位于20号染色体上的EaTLR2-1aEaTLR2-1b的表达模式也高度相似,均在脑中高表达;EaTLR5MEaTLR5S同位于14号染色体上,二者不仅具有高度相似的LRR结构域,且在不同组织中的表达水平也高度相似;而位于18号染色体的EaTLR7与EaTLR8和位于4号染色体的EaTLR2-2与EaTLR3,其表达模式却存在明显差异。研究结果可为鱼类Toll样受体系统进化分析提供参考数据,也为进一步研究赤点石斑鱼Toll样受体基因的功能奠定基础。
大口黑鲈鲁氏耶尔森氏菌的分离鉴定、致病性及主要毒力基因研究
王巧煌, 林楠, 元丽花, 季静, 林丹
 doi: 10.11964/jfc.20220213326
[摘要](56) [HTML 全文](17) [PDF 2822KB](0)
摘要:
为探明2021年3月福建某水库养殖大口黑鲈疾病暴发的原因,实验从患病大口黑鲈肝脏、肾脏、脾脏中分离优势菌,通过人工感染实验确定病原菌,并综合16S rDNA基因序列分析、生理生化和质谱特征等技术对该病原菌进行种属鉴定,同时,进行毒力基因检测、药物敏感性实验以及组织病理学观察。结果显示,从病鱼脾脏中分离获得1株优势菌并鉴定为鲁氏耶尔森氏菌;该菌株对大口黑鲈的半致死剂量为3.8×105 CFU/尾;该菌株携带yrP1、yhlAyhlB等毒力基因,对恩诺沙星、盐酸多西环素、氟甲喹、硫酸新霉素、氟苯尼考等5种药物相对敏感。组织病理学观察发现,鲁氏耶尔森氏菌的感染造成大口黑鲈肝脏、肾脏、脾脏不同程度的损伤,表现为明显的变性、坏死及炎症细胞的浸润等。本研究首次报道了鲁氏耶尔森氏菌对养殖大口黑鲈的致病性,可为养殖大口黑鲈鲁氏耶尔森菌病的诊断和药物防治提供参考依据。
大口黑鲈蛙病毒分子流行病学及组织病理分析
杨展展, 林强, 付小哲, 罗霞, 刘礼辉, 梁红茹, 牛银杰, 左绍志, 张晓婷, 李宁求
 doi: 10.11964/jfc.20220113317
[摘要](42) [HTML 全文](16) [PDF 3450KB](0)
摘要:
为探讨大口黑鲈蛙病毒 (LMBV) 的分子流行规律及在感染后的组织病理变化,实验对2019—2021年采集的723份患病大口黑鲈样品进行荧光定量PCR (qPCR)检测。结果显示,LMBV的阳性率为63.62%,挑选阳性样品接种鳜脑细胞 (Chinese perch brain cells, CPB),共获得93株LMBV。通过对分离株MCP、ATP酶、DNA聚合酶和甲基转移酶基因进行PCR扩增与测序分析,发现上述基因在LMBV分离株中均保守,其中MCP、ATP酶基因一致性均为100%、甲基转移酶基因一致性为99.7%~100.0%、DNA聚合酶基因一致性为99.8%~100.0%。选取1株LMBV毒株感染健康大口黑鲈,采用qPCR方法对不同组织中的病毒载量进行检测,结果显示,大口黑鲈蛙病毒在心脏、肝脏、脾脏、肾脏、胃、肠和脑等组织中均有分布,人工感染LMBV后的前5天病毒载量逐步升高;感染后第5天,心脏中病毒载量最高 (9.5×105个/ mg拷贝),脑组织中病毒载量最低 (2.9×102个/ mg拷贝)。组织病理结果表明,LMBV可导致大口黑鲈多种组织坏死,其中肝脏、肾脏和心脏病变较为严重,典型病理特征包括肝细胞排列紊乱、肝窦扩张、核质疏散;肾组织细胞疏散、巨噬细胞破裂;心室外膜纤维坏死等。实验结果可为大口黑鲈蛙病毒病防控提供参考。
GABA受体拮抗剂荷包牡丹碱和CGP52432对厚壳贻贝幼虫变态的影响
王林雨, 史雪, 杨跃明, 王雨晴, 梁箫, 杨金龙, 李一峰
 doi: 10.11964/jfc.20211113141
[摘要](85) [HTML 全文](26) [PDF 1445KB](0)
摘要:
为研究GABA及其受体拮抗剂荷包牡丹碱 (GABAA受体)和CGP52432 (GABAB受体)在厚壳贻贝幼虫附着变态中的调控作用,实验通过分析厚壳贻贝不同发育阶段幼虫转录组数据获得GABA受体相关蛋白基因 (GABARAP)和GABAB2受体基因 (GABAB2R),发现GABAB2R在变态前期的眼点幼虫阶段相较于其他阶段幼体显著高表达。通过实时荧光定量PCR验证也得到相似的表达模式,显示GABAB2R可能参与调控厚壳贻贝幼虫变态发育。药理学实验结果显示,10−4 mol/L GABA对厚壳贻贝幼虫的变态具有诱导活性 (27.2%±3.0%)。在拮抗剂实验中,10−6~10−4 mol/L荷包牡丹碱和CGP52432均显著抑制了厚壳贻贝幼虫变态,且抑制作用随浓度升高而增强。实验还发现GABA及其受体拮抗剂都抑制了厚壳贻贝幼虫的游泳行为。研究表明,GABAA或GABAB受体拮抗剂均对厚壳贻贝幼虫附着变态具有抑制作用,GABA受体可能参与调控厚壳贻贝幼虫附着变态过程。
十足目虹彩病毒1的研究进展
绳秀珍, 吴明顺, 叶海斌, 王晓璐, 王友红, 于晓清, 许拉, 刘洪军
 doi: 10.11964/jfc.20211013094
[摘要](65) [HTML 全文](21) [PDF 0KB](2)
摘要:
虾虹彩病毒病是一种感染甲壳类的急性、传染性疾病,其病原为虹彩病毒科的一个新属即十足目虹彩病毒属的十足目虹彩病毒1 (Decapod iridescent virus 1,DIV1)。DIV1传播速率快、宿主范围广、致死率高,近年来在对虾养殖过程中广泛流行,给我国对虾养殖业造成巨大经济损失。目前,在DIV1病的病原学、病理学、流行病学、检测诊断等方面已开展了部分研究,但对病毒感染的分子机制、宿主的应答规律等还知之甚少。本文对十足目虹彩病毒1的发现过程、分类地位、形态特征、感染特性、机体响应机制、基因组信息、宿主范围、传播途径、检测方法等方面的最新研究进展进行了综述,阐述了疾病防控及未来展望,以期为虾虹彩病毒病的深入研究及有效防控提供参考。
刺激隐核虫钙调蛋白基因的分子鉴定
倪炜, 张经伟, 余玲莹, 黄晓红
 doi: 10.11964/jfc.20210512814
[摘要](44) [HTML 全文](24) [PDF 1990KB](0)
摘要:
为了解钙调蛋白在刺激隐核虫生长发育过程中的作用,实验从刺激隐核虫滋养体cDNA文库中克隆出钙调蛋白基因 (cicam),优化密码子后人工合成开放阅读框 (ORF),构建成重组质粒pGEX-4T-1/cicam,将其转化至大肠杆菌后,用ZYM-5052自诱导培养基诱导重组子表达。用谷胱甘肽琼脂糖凝胶及凝血酶纯化重组蛋白rCiCaM,并用其免疫小鼠BALB/c株获得多克隆抗体。分别用逆转录PCR和免疫印迹实验检测cicam及其编码蛋白CiCaM在各期虫体中的表达。用间接荧光抗体实验检测CiCaM在幼虫中的定位。通过覆盖印迹实验 (Blot overlay assay)初步探讨了重组蛋白rCiCaM结合重组肌动蛋白解聚因子的活性。结果显示,cicam的ORF为450 bp,编码含149个氨基酸的肽链,其分子量预测值为16.9 ku;原核表达的融合蛋白GST-rCiCaM及切除GST标签的rCiCaM的表观分子量分别为43和16.9 ku,均与预测值相符;cicam在刺激隐核虫的各个发育阶段都有稳定的表达,其表达产物CiCaM的分子量与预测值相符;在幼虫细胞内CiCaM在胞质中均有分布,尤以在4个大核周围及胞口部位更为富集;CiCaM与CiADF2之间可能发生Ca2+依赖性的相互作用。该研究丰富了刺激隐核虫病原分子生物学知识,为刺激隐核虫病防治方法的开发提供参考。
大黄鱼种质资源保护与利用现状及建议
徐鹏, 柯巧珍, 苏永全, 刘家富, 郑炜强
 doi: 10.11964/jfc.20210312688
[摘要](150) [HTML 全文](62) [PDF 1971KB](10)
摘要:
优异种质资源的发掘利用对保障我国优质水产蛋白供给具有关键作用。大黄鱼是我国海水鱼类养殖产量最高的品种,种质资源是大黄鱼养殖产业健康和可持续发展不可或缺的物质基础,系统开展大黄鱼种质资源收集保存、鉴定评价和保护利用具有十分重要的战略意义。本文回顾了大黄鱼种质资源保护和开发利用的历史与现状,从科研、育种技术体系、产业和人才等方面剖析了当前面临的主要问题,围绕大黄鱼种业科技创新和新品种创制主线,提出了针对复杂经济性状 (如抗病、抗逆和饲料利用效率等)创制重大新品种的发展方向,为实现大黄鱼良种覆盖率的显著提升,以及大黄鱼产业健康发展提供良种保障。
皱纹盘鲍脯氨酰内肽酶的分离纯化及性质
陈守峰, 杨汝晴, 陈玉磊, 孙乐常, 张凌晶, 刘光明, 曹敏杰
 doi: 10.11964/jfc.20201212599
[摘要](159) [HTML 全文](59) [PDF 1978KB](1)
摘要:
为探究脯氨酰内肽酶(PEP)在皱纹盘鲍性腺发育过程中的作用,实验采用荧光定量PCR (qRT-PCR)技术分析皱纹盘鲍不同组织中PEP的表达情况。通过硫酸铵分级沉淀和连续柱层析,从皱纹盘鲍性腺中分离纯化得到高纯度天然PEP。利用LC/MS/MS鉴定肽片段序列,以Suc-Gly-Pro-MCA为底物分析PEP的酶学性质。利用圆二色谱分析温度对PEP结构的影响。采用免疫印迹(Western Blot)和qRT-PCR分析鲍性腺在不同发育时期PEP的蛋白和基因表达水平。结果显示,皱纹盘鲍的性腺中,PEP基因表达量和酶活性最高。利用硫酸铵分级沉淀和连续柱层析,从性腺中分离纯化得到分子量约为82 ku,等电点约为5.5的PEP,LC/MS/MS分析得到502个氨基酸残基,与NCBI中皱纹盘鲍脯氨酰内肽酶(KY214290)一致。PEP的最适温度和最适pH分别为25 °C和6.0,在15~25 °C和pH 5~8条件下能够保持较高的活性。随着温度升高,PEP的二级结构有明显的改变,拟合热变性温度为(51.4±0.2) °C。PEP在雄性和雌性性腺的各个生长期均能被检测到,在雄性性腺的成熟中期和雌性性腺的成熟后期表达量最高。研究表明,PEP在鲍性腺不同发育时期表达量的差异表明其可能参与性腺发育的过程。
甘露寡糖对高糖饲喂下尼罗罗非鱼肌肉品质的影响
马莹莹, 贾永义, 顾亭亭, 张志勇, 王童, 张美玲, 杜震宇, 乔芳
 doi: 10.11964/jfc.20210712941
[摘要](162) [HTML 全文](77) [PDF 1860KB](6)
摘要:
甘露寡糖是一种新型饲料添加剂,但是它对于鱼类肌肉品质的影响并无系统性报道。为此,本实验选择均体质量为(2.2±0.2) g的健康尼罗罗非鱼幼鱼315尾,随机分成对照组 (C,糖含量为35% )、高糖处理组 (HC,糖含量为45% )和高糖饲料中添加甘露寡糖处理组 (HM,糖含量为45%,甘露寡糖添加量为0.5% ),每组3缸,每缸35尾,投喂10周后,测定其生长指标、肌肉营养成分和质构特性等相关指标。结果显示,与对照组相比,HC组尼罗罗非鱼肝体比、肌肉内聚性、肌纤维数量、肌苷酸含量、鲜味氨基酸占比、甘油三酯含量以及可促进肌肉生长的钙蛋白酶抑制蛋白基因CAST相对表达量均显著升高;肌肉硬度、胶着性、咀嚼性、肌纤维直径、蒸煮损失、必需氨基酸占比、在肌纤维的分化中起着重要作用的MyoG基因相对表达量以及脂肪酸、甘油二酯和磷脂酰肌醇含量显著降低。与HC组相比,HM组尼罗罗非鱼的肌肉弹性、必需氨基酸占比,脂肪酸和甘油二酯含量以及CAST基因相对表达量显著增加;肌肉粘力、肌纤维数量、肌苷酸含量,磷脂酰乙醇胺和磷脂酰胆碱含量以及MyoG基因相对表达量均显著降低。与对照组相比,HM组尼罗罗非鱼增重率和肌肉内聚性,甘油三酯和脂肪酸含量显著增加;肝体比,肌肉硬度、咀嚼性以及磷脂含量均显著降低。总之,甘露寡糖可以提高高糖饲喂下尼罗罗非鱼的产肉率、肌肉保水性、肌肉口感和氨基酸营养价值来提升其品质,但是其对于肌肉中磷脂的影响也不容忽略。
条斑紫菜单孢子形成相关基因(PyMFG)的特性及其表达差异
宋珊珊, 丁洪昌, 严兴洪
 doi: 10.11964/jfc.20190311710
[摘要](1946) [HTML 全文](599) [PDF 2804KB](43)
摘要:
以条斑紫菜转录组测序筛选得到的差异性表达基因(Contig-21827)序列为基础,采用RT-PCR技术克隆得到了条斑紫菜单孢子形成相关基因PyMFG的完整开放阅读框。对其进行序列分析发现,PyMFG基因的ORF全长为1 224 bp,编码一个包含407个氨基酸的多肽片段,其分子量为46.24 ku,等电点为9.08。结构域分析结果显示,该蛋白含有保守的TEA结构域和YAP结构域,属于TEA-ATTS超家族结构域。通过多序列比对和系统进化分析发现,该蛋白与真菌分生孢子形成蛋白聚为一个大的分支,亲缘关系较近。此外,不同品系间的单孢子放散能力和qRT-PCR分析结果显示,PyMFG基因在PY26WPY26W'品系中的表达趋势与宏观统计结果高度一致,在PY26RPY26R'品系中的表达则与统计结果存在差异。由此推断,父本(PY26W)/偏父本品系(PY26W')中调控单孢子形成、放散的相关基因种类和具体分子机制与母本(PY26R)/偏母本品系(PY26R')存在差异,因而导致单孢子的宏观统计结果与荧光定量结果存在差异。
            

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封面
2022年4期封面
2022, 46(4): -.  
[摘要](79) [PDF 22539KB](17)
摘要:
目录
2022年4期目录
2022, 46(4): 1-2.  
[摘要](67) [HTML 全文](63) [PDF 217KB](13)
摘要:
半滑舌鳎lnc-XR_003049606.1及其靶基因pmelb在无眼侧皮肤黑化过程中的表达
胡元日, 杨倩, 王佳林, 李仰真, 许岩岩, 崔忠凯, 程鹏, 陈松林
2022, 46(4): 529-536.   doi: 10.11964/jfc.20211113161
[摘要](161) [HTML 全文](88) [PDF 4500KB](27)
摘要:
为探究人工养殖半滑舌鳎无眼侧皮肤经常出现黑化现象的成因,实验根据本课题组前期全转录组数据分析结果预测得出lnc-XR_003049606.1与pmelb在基因层面上存在反式调控的关系。在半滑舌鳎无眼侧黑化皮肤中克隆获得pmelb的cDNA序列。生物信息学分析结果显示,pmelb的cDNA序列全长1 755 bp,编码584个氨基酸,其预测的蛋白分子量为63.94 ku,理论等电点为5.12,预测的二级蛋白结构含有1个Pleckstrin同源域、1个布鲁顿酪氨酸激酶富胱氨酸基序、1个Src同源3域、1个Src同源2域和1个酪氨酸激酶催化结构域。系统进化树分析显示, pmelb与其他鱼类对应的基因聚为一支。氨基酸同源性分析显示,半滑舌鳎的pmelb与大菱鲆和牙鲆的相似性最高 (分别为68.05%和66.28%)。分别通过分析半滑舌鳎lnc-XR_003049606.1和pmelb的表达分析发现,lnc-XR_003049606.1在1龄半滑舌鳎的皮肤和肝脏中表达,皮肤中表达量在60 d达到顶峰,随着时间延长而降低;而pmelb则主要在皮肤中表达,表达量在时间线上先升高再降低。本研究初步探究了lnc-XR_003049606.1和pmelb间的表达关系,为进一步筛选半滑舌鳎无眼侧黑化过程中起作用的关键基因提供了思路。
三角帆蚌kinase X基因的克隆及功能初探
崔晓羽, 董赛赛, 段胜华, 汪桂玲, 李家乐
2022, 46(4): 537-545.   doi: 10.11964/jfc.20201012453
[摘要](204) [HTML 全文](80) [PDF 1961KB](20)
摘要:
三角帆蚌是我国特有的淡水育珠蚌,在养殖业中占有重要地位,在实际养殖过程中,雄性个体有着明显的产珠优势,因此对性别决定的相关研究至关重要。研究发现Sox9基因在许多物种中起到性别决定的作用,kinase X基因是蛋白激酶(PKA)合成中至关重要的基因,而Sox9基因很可能受到PKA激酶的调控。实验通过RACE法克隆kinase X基因的全长cDNA序列,使用荧光定量PCR的方法检测该基因在2龄雌雄三角帆蚌各组织中的相对表达量,利用RNA干扰技术研究干扰链对kinase X基因及下游基因Sox9基因表达的影响。结果显示,kinase X基因全长1 652 bp,编码430个氨基酸;荧光定量PCR结果显示,kinase X基因在雄性性腺中表达量最高,雌雄间差异极显著;RNA干扰结果显示,合成的干扰链均对kinase X基因有着一定的干扰效率,其中干扰链1的干扰率最高,在雌性中的干扰率为83.1%,雄性中为81.9%,同时干扰链1干扰后Sox9基因的表达量在雌性中下降了90.3%,雄性中下降了56.6%,推测这两个基因可能参与性别决定过程。本实验为三角帆蚌性别决定和雄性单性化育种研究提供理论基础。
滆湖鱼类群落时空分布及其与环境因子的关系
李经纬, 徐东坡, 李巍, 孔优佳, 花少鹏, 刘其根, 张顺, 胡忠军
2022, 46(4): 546-556.   doi: 10.11964/jfc.20200812358
[摘要](177) [HTML 全文](71) [PDF 1782KB](15)
摘要:
为掌握滆湖鱼类群落现状及动态,于2017—2018年在该湖设置16个采样点,使用多网目刺网和地笼对鱼类群落进行了周年季度采样,同时测定各采样点的水温(WT)、水深(WD)、透明度(SD)、pH值、叶绿素a (Chl.a)、总氮(TN)和总磷(TP)等环境因子,定量分析了鱼类群落结构特征、时空分布格局及其与环境因子的关系。研究期间共采集鱼类36种,隶属4目8科。相对重要性指数(IRI)显示,刀鲚为优势种,鲢和鲫为常见种。在3种生态类群中,定居型鱼类物种数最多(83.3%);在5种功能摄食群中,杂食性鱼类物种数最多(47.2%),鱼类物种组成在月份间和空间上均无显著差异。双因素方差分析表明,单位努力捕获数量(NPUE)、丰富度指数(R)、Shannon多样性指数(H´)和Pielou均匀度指数(J)的季节性差异显著,但单位努力捕获重量(BPUE)在季节间无差异,以上5个参数中仅R存在显著的空间变化。冗余分析(RDA)结果表明水温和TP是影响鱼类物种时空分布的关键环境因子。研究表明,自20世纪50年代以来,滆湖鱼类多样性下降明显,物种组成和产量发生了明显变化,推测与水质污染导致的水草急剧退化、增殖放流、过度捕捞和江湖阻隔有关。
黄海南部近岸水域棘头梅童鱼仔稚鱼的分布和漂移趋势
邹明汐, 陈渊戈, 宋小晶, 李圣法, 钟俊生
2022, 46(4): 557-568.   doi: 10.11964/jfc.20201112499
[摘要](127) [HTML 全文](67) [PDF 6149KB](8)
摘要:
鱼类早期资源特征对鱼类种群的研究和渔业资源的评估管理具有极大的价值。实验于2019年3月—2020年1月在黄海南部近岸水域设置47个站点,每月大潮期间使用仔稚鱼网采集仔稚鱼,揭示了棘头梅童鱼仔稚鱼丰度的时空分布特征和漂移趋势,采用广义相加模型分析环境因子与之关联。调查共采集到棘头梅童鱼仔稚鱼2 385尾,出现在6—10月,6月丰度最高 (165.15 尾/100 m3),并呈逐月降低的趋势,同时各月样品中最优势的发育阶段依次从前弯曲期仔鱼变为了稚鱼。前弯曲期和弯曲期仔鱼集中分布在北部靠近海州湾水域,向海扩散的范围相对较大,后弯曲期仔鱼和稚鱼则集中分布在中部近岸水域。GAM模型结果显示,经纬度对丰度的偏差解释率最高,为52.3%,其次是月份和表层盐度。研究表明,实验所涉及黄海南部近岸水域是棘头梅童鱼早期阶段的保育场,其仔稚鱼可能主要来自于海州湾海域6月的产卵群体,鱼卵和前弯曲期仔鱼被动漂流扩散开后,随着生长发育,同时在表层盐度、表层水温和水深等环境因子的影响下,一部分后弯曲期仔鱼和稚鱼向岸聚集。9月整个早期群体都发育到稚鱼为主,并随后从仔稚鱼网的样本中消失。
海洋环境变化对北太平洋柔鱼个体生长的影响
王岩, 陈新军, 方舟
2022, 46(4): 569-582.   doi: 10.11964/jfc.20201012455
[摘要](493) [HTML 全文](219) [PDF 2624KB](31)
摘要:
海洋环境变化会对海洋生物个体大小及其生长产生影响,特别是短生命周期的种类。为此根据2009—2012、2015—2016年8—10月采集的6091尾北太平洋柔鱼样本,对其渔业生物学特征进行了研究,并分析海洋环境因子对其个体生长的影响。结果显示,雌雄个体生物学特征在不同海洋环境年均存在显著差异。柔鱼胴长与太平洋年代际涛动指数(Pacific decadal oscillation index,PDOI)呈滞后1年的正相关。PDO冷期厄尔尼诺年(2009年)柔鱼个体较同期拉尼娜年(2010和2011年)柔鱼个体大,但超强厄尔尼诺年(2015年)柔鱼个体明显偏小。同时,超强厄尔尼诺年(2015年)出现低SST和Chl. a浓度的现象,不利于柔鱼生长,并抑制性腺发育。而较高SST和Chl. a浓度为柔鱼提供良好的生存环境,有利于性腺发育,柔鱼个体相对较大。研究表明,不同海洋环境年柔鱼生物学特征存在一定的差异,同时PDO、厄尔尼诺/拉尼娜事件、SST和Chl. a浓度的综合作用是影响个体大小的主要因素。
基于微卫星标记评估凡纳滨对虾收获体长、体质量以及抗WSSV性状的遗传参数
孙坤, 李旭鹏, 隋娟, 曹家旺, 谭建, 罗坤, 栾生, 孔杰, 孟宪红
2022, 46(4): 583-593.   doi: 10.11964/jfc.20200512253
[摘要](156) [HTML 全文](71) [PDF 2384KB](10)
摘要:
为更加准确地评估凡纳滨对虾体长、体质量以及抗WSSV性状的遗传参数,实验利用8个微卫星位点对凡纳滨对虾69个家系母本和子代进行基因分型,并利用分型信息进行系谱重构和分子亲缘关系相关度的计算,以重构系谱、分子亲缘关系度以及物理系谱分别构建加性遗传相关矩阵,进而对体长、体质量和抗WSSV性状的遗传参数进行评估。最终通过交叉验证的方法,比较三者对遗传参数评估的预测能力以及准确性。分型结果显示,8个微卫星位点,共检测到166个等位基因,各位点等位基因数为12~45个,亲本和子代群体每个位点平均等位基因数分别为9.50个和18.13个,平均观测杂合度分别为0.618和0.709,平均期望杂合度分别为0.749和0.775,平均多态性信息含量分别为0.711和0.750,所有位点均表现高度多态性。遗传力分析结果显示,利用物理系谱、重构系谱以及分子亲缘相关度对体长的遗传力估计值分别为0.119±0.031、0.120±0.032、0.132±0.030,对体质量的遗传力估计值分别为0.176±0.039、0.182±0.040、0.172±0.034,对抗WSSV性状的遗传力估计值分别为0.135±0.033、0.134±0.033、0.098±0.031,在体长、体质量以及抗WSSV性状的遗传力中,以分子亲缘相关度评估的标准差小于重构系谱和物理系谱。通过交叉验证,三者对遗传参数评估的预测能力以及准确性从高到低分别为分子亲缘相关度、重构系谱、物理系谱。研究表明,利用微卫星分子标记评估凡纳滨对虾体长、体质量以及抗WSSV性状遗传参数比利用物理系谱评估具有更高的准确性,但同样利用微卫星分子标记进行遗传评估,直接利用子代的亲缘相关度比重构系谱具有更好的效果。本研究为凡纳滨对虾遗传参数的评估提供了更为精确的方法,为进一步良种选育提供了参考资料。
一株虹鳟源嗜冷黄杆菌CH06的基因组进化及毒力相关基因分析
陈福广, 李绍戊, 卢彤岩
2022, 46(4): 594-604.   doi: 10.11964/jfc.20200912406
[摘要](132) [HTML 全文](54) [PDF 6336KB](5)
摘要:
为了深入揭示我国鱼类病原菌嗜冷黄杆菌的基因组进化及其致病机制,本实验对嗜冷黄杆菌毒力菌株CH06进行全基因组测序,比较基因组分析并挖掘其毒力相关基因。基因组测序结果显示,CH06的基因组大小为2 836 981 bp,GC含量为32.56%,注释出2 437个编码基因。通过平均核苷酸一致性 (ANI) 分析结果显示,CH06与12株嗜冷黄杆菌的ANI值均高于99%,菌株CH06应属于嗜冷黄杆菌分支。基因组序列分析发现,CH06含有5个插入序列、4个基因岛和3个前噬菌体,揭示这些可移动遗传元件推动了CH06的基因组进化。系统进化树和基因组共线性分析发现,CH06与菌株CSF259-93和FPG101亲缘关系较近。分泌系统分析显示,CH06中存在Ⅰ型分泌系统(type I secretion system,T1SS)和Ⅸ型分泌系统 (T9SS)。通过蛋白结构域特征分析发现,CH06包含56个T9SS效应蛋白和29个双组分系统元件,表明嗜冷黄杆菌可能存在复杂的致病机制和调控机制。本研究对CH06的基因组进化以及毒力相关基因进行分析,为我国鱼类病原嗜冷黄杆菌的进化、多样性及致病机制研究提供参考。
基于束缚的胁迫调控对潜水采捕虾夷扇贝活品贮运稳定性的影响
李亚烜, 刘俊荣, 周进, 赵前, 田元勇, 徐昙烨
2022, 46(4): 605-615.   doi: 10.11964/jfc.20200912394
[摘要](133) [HTML 全文](66) [PDF 2061KB](3)
摘要:
通过人工束缚对活体施加胁迫调控干预,探讨流通环节虾夷扇贝的活力保持机制,为开发贝类高端活品提供理论及方案等参考。参考实际流通链,设置由2 d活水暂养和4 d无水贮运构成为期1周的模拟活品供应链;设计两个处理组,分别为暂养前束缚组(Tb)和暂养后束缚组(Ta),对照组C则全程无束缚。期间对扇贝闭壳肌ATP关联物、腺苷酸能荷(AEC)、磷酸精氨酸ArP、pH及糖原等生化指标进行分析,同时对比表观活力及风味品质变化进行全面分析比较。结果显示,束缚处置具有明显的胁迫调控效果,有助于活品在贮运环节活体活力的保持,且束缚发生越早效果越好。具体表现:①ATP,ArP,糖原等与活力有关的生化指标分析结果为Tb>Ta>C,在模拟流通链第6天时,处理组各项生化指标均优于对照组C,并且Tb组更具优势。②外套膜的缩边程度与刺激响应时间两个表观活力指标呈正相关,缩边程度越大则刺激响应时间越长,即活力状态越差。束缚调控措施在暂养环节对各组活力影响差别不大,但在后续无水贮运期间则呈现了明显的延迟效应,刺激响应时间依次为C>Tb>Ta,揭示束缚使扇贝进入临时“休眠”状态而对外界刺激迟缓;此外,不同束缚时间节点对活力保持效果也呈现差异,Tb组后期活力优于Ta组。③束缚对暂养中各组活品风味特性的影响差异不大,但同样对无水贮运的活品产生明显的延迟效应;虽各组风味品质均呈下降趋势,但Tb组则呈现明显的鲜味和甜味优势,表明早期束缚对活品风味品质的维持同样存在积极作用。研究表明,束缚可有效地对活品扇贝进行胁迫调控,以减少活品贮运过程中的能量消耗进而保持活力,且早期束缚更有利于对活品活力和风味品质的维护。
东海岱衢族大黄鱼资源变动的原因探析及重建策略
俞存根, 严小军, 蒋巧丽, 臧迎亮
2022, 46(4): 616-625.   doi: 10.11964/jfc.20211013126
[摘要](145) [HTML 全文](70) [PDF 1641KB](9)
摘要:
东海岱衢族大黄鱼历史上曾是我国近海特有的最重要底层经济鱼类之一,但现在是我国着力恢复与重建的重要对象。为阐明大黄鱼资源变动及其衰退的影响因素,揭示大黄鱼对栖息地的选择性及其资源难以恢复的原因,本研究以1950—2020年浙江省大黄鱼捕捞产量为样本,运用指标分析法,分析岱衢族大黄鱼资源种群数量变动与敲罟作业、围捕“中央渔场”越冬群体等渔业重大事件的相关性,追踪导致大黄鱼资源衰退的原因;通过文献综合分析法,阐述了大黄鱼生物学特性及其演变和对栖息地的适应性表现。结果显示:①大黄鱼资源衰退乃至枯竭的主要原因是敲罟作业、拦捕进港鱼和捕捞越冬场等不合理开发利用方式引起;②大黄鱼具有寿命长、性成熟晚、种群结构复杂等特点,同时还有较强的栖息地环境选择性,其中温度、盐度、流速、底质、饵料生物是关键环境要素;③由于过度捕捞,大黄鱼的生活史型虽然也偏离了原来的选择位置,但仍然属于K选择对策者。研究表明,大黄鱼资源难以恢复的主要因素除了人为因素(如捕捞强度过大)影响外,可能还与大黄鱼偏K选择的生活史型与栖息地的选择性有关。本研究从生物学特性及栖息地的环境选择性角度提出了大黄鱼今后的保护与增殖策略,为恢复与重建东海岱衢族大黄鱼资源提供了决策依据。
试论黄河三角洲生态农牧化高质量发展的策略与途径
袁秀堂, 于正林, 王清, 刘辉, 张立斌, 林承刚, 王天明, 刘富祥, 许家磊, 杨红生
2022, 46(4): 626-635.   doi: 10.11964/jfc.20220113291
[摘要](113) [HTML 全文](54) [PDF 1694KB](5)
摘要:
黄河三角洲自然资源丰富、生态系统独特,其生态保护和高质量发展已上升为国家战略。在资源环境约束趋紧、生态系统退化的严峻形势下,黄河三角洲生态农牧化是实现其高质量发展的重要方式之一。为构建绿色、低碳、循环的黄河三角洲生态农牧化新模式,本研究分析了其高质量发展面临的问题,提出其发展的理念和目标。在此基础上,针对性地提出多元驱动的高质量发展策略与途径,即通过“场景驱动”以优化宏观布局,利用“种业牵动”、“牧养互动”和“装备推动”以完善产业体系,采用“强强联动”以创新协同范式,运用“政策促动”以实现整体升级,构建场景匹配的三场连通、三产融合的黄河三角洲生态农牧化发展新模式,实现机械化、智能化、数字化和体系化的协同发展。研究结果可为推动黄河三角洲生态农牧化高质量发展提供参考。
综述
基因编辑技术在贝类中的应用进展与展望
于红, 刘欣, 李琪
2022, 46(4): 636-643.   doi: 10.11964/jfc.20210813004
[摘要](155) [HTML 全文](62) [PDF 1876KB](15)
摘要:
基因编辑是进行生物体遗传修饰的重要手段,已广泛应用于功能基因组学研究、动物模型制备、动植物遗传改良、基因治疗等多个研究领域。近年来CRISPR/Cas9技术的出现更是为生命科学领域带来一场技术革命,高效、精准、低成本的CRISPR技术已成为目前人们探究基因功能、解析生命现象的重要工具,在贝类中的应用也日益增多。本文就基因编辑技术的发展、作用原理及其在贝类中的应用进展进行综述,并对其未来发展进行了分析展望,以期推动该技术在贝类研究中得到更广泛的应用,为贝类基因功能解析、经济性状调控、基因挖掘、遗传改良等研究提供参考。
雌雄同体鱼类性别分化及性转变研究进展
赵会宏, 何琪, 张春丽, 王庆, 张勇, 杨慧荣, 林芳妹, 李育森, 石和荣, 张海发
2022, 46(4): 644-656.   doi: 10.11964/jfc.20200612311
[摘要](136) [HTML 全文](60) [PDF 3420KB](14)
摘要:
在脊椎动物中,鱼类具有多样的性别分化方式,大致可分为雌雄异体、雌雄同体以及单性生殖3类。一般情况下,鱼类性别决定后,性腺可分化为卵巢或精巢,并且在整个生命周期内保持不变。而在雌雄同体鱼类,其性别可以从雌性转变为雄性、雄性转变为雌性或者在雌雄两种性别间进行多次转变。雌雄同体鱼类具有多种性别转变形式,是研究脊椎动物性别决定与分化的理想模型。因此,本文从性腺发育组织学变化、性激素分泌、神经内分泌、性别决定与分化基因的分子调控等方面,综述了近年来雌雄同体鱼类性别分化与性转变相关的研究进展,为更深入地研究鱼类性别调控机制提供参考。
中国大鲵种质资源保护与利用研究进展
蒋万胜, 兰香英, 王金秀, 向红梅, 田贺, 罗庆华
2022, 46(4): 683-705.   doi: 10.11964/jfc.20210812993
[摘要](214) [HTML 全文](83) [PDF 4375KB](4)
摘要:
中国大鲵是全球现生最大的两栖动物,具有重要的科研、生态与经济价值。按照我国现行法律法规,野生大鲵是国家二级保护动物,但人工养殖子二代及之后子代可作为水产品或药食资源加以利用。作为一种我国特有且珍稀的水生动物,在兼具保护与利用的双重特性下,大鲵种质资源现状一直备受关注。然而,尽管有多重保护地位加身,其野生种群现状依然不容乐观,目前的自然保护区就地保护方式与人工增殖放流迁地保护方式在实施方式和效果层面均有待评估与优化。与之相对的是,随着人工繁养殖技术的逐步成熟,养殖规模的日益扩大,人工养殖大鲵逐渐成为一种较具市场前景的新兴养殖品种。然而,养殖过程中疾病防治仍是目前最大的瓶颈问题之一。大鲵属于高蛋白低脂肪类高端水产品,其蕴含的生物活性成分和功效正在逐步被揭示。受市场供需、产业发展与科研投入的影响,目前其养殖规模仍然较小,产品开发利用的广度和深度仍亟待加强。本文基于前人研究结果和团队的工作实践,从大鲵基本生物学及栖息地特征、遗传多样性、种质资源保护、人工繁殖与疾病防治、营养活性成分与产业化利用等方面对其种质资源保护与利用进行了综合概述,总结成功经验,指出存在问题,以期为未来针对这一特有珍稀物种的种质资源研究、保护方案制订、开发与可持续利用以及科普宣传等方面提供重要参考。
中国深蓝渔业发展现状与未来愿景
刘永新, 刘晃, 方辉, 徐皓, 王鲁民, 刘英杰
2022, 46(4): 706-717.   doi: 10.11964/jfc.20210512869
[摘要](255) [HTML 全文](103) [PDF 1769KB](19)
摘要:
深蓝渔业是“养-捕-加”一体化、“海-岛-陆”相联动的全产业链渔业生产体系,是实现“以养为主、三产融合”的战略性新兴产业,也是我国现代海洋渔业转型升级的重要方式和有机载体。其生产体系覆盖我国黄渤海、东海、南海的近海和远海以及大洋极地等海洋空间,将“种-养-捕-加-网”等不同关键环节结合成为一个有机整体,是“蓝色粮仓”的拓展与延伸,对于保障优质蛋白供给、拓展养殖新空间、支撑蓝色经济增长和坚守国家海洋权益等具有重要作用。近年来,伴随着科技工作日益加强与产业化实践不断深入,深蓝渔业发展面临的机遇与挑战逐步涌现。本文综合分析了发展深蓝渔业的战略意义,阐述了其蕴含的主要生产功能,总结了制约发展的突出问题,在针对发展目标的基础上提出了开展深蓝生物遗传资源解析、打造工业化绿色生产模式、高品质捕捞大洋极地资源、研发海陆联动加工技术与装备、构建渔业船联网系统等重点科技任务,凝练了实施科技能力提升工程、出台产业发展扶持政策、打造多元人才聚集高地、建立产业创新示范园区等措施建议,旨在为促进深蓝渔业科技进步和推动产业迭代升级提供借鉴与参考。

期刊介绍

  • 创刊:1964年  月刊
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国水产学会
  • 出版单位:科学出版社
  • 编辑单位: 《水产学报》编辑部

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